45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4482 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4482  putative inner membrane protein  100 
 
 		 142 aa  280  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.877006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4299  hypothetical protein  99.29 
 
 		 142 aa  277  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4414  hypothetical protein  99.29 
 
 		 142 aa  277  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0644403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4329  hypothetical protein  99.29 
 
 		 142 aa  276  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4412  hypothetical protein  98.59 
 
 		 142 aa  276  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.692782  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4064  protein of unknown function DUF805  90.78 
 
 		 146 aa  263  7e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4097  hypothetical protein  90.78 
 
 		 146 aa  263  7e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4361  hypothetical protein  90.78 
 
 		 146 aa  263  7e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375451 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5376  hypothetical protein  90.78 
 
 		 146 aa  263  7e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03755  hypothetical protein  90.78 
 
 		 146 aa  263  7e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03806  conserved inner membrane protein  90.78 
 
 		 146 aa  263  7e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4455  hypothetical protein  90.07 
 
 		 146 aa  262  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4152  hypothetical protein  90.07 
 
 		 146 aa  261  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4401  hypothetical protein  91.47 
 
 		 129 aa  238  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4050  hypothetical protein  73.38 
 
 		 139 aa  206  8e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0098  hypothetical protein  68.79 
 
 		 153 aa  196  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0097  hypothetical protein  68.79 
 
 		 144 aa  196  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0171  protein of unknown function DUF805  60.43 
 
 		 140 aa  184  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0156  hypothetical protein  60.43 
 
 		 140 aa  183  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3806  protein of unknown function DUF805  63.57 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4803  hypothetical protein  68.79 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0105  protein of unknown function DUF805  59.57 
 
 		 141 aa  167  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4116  hypothetical protein  63.87 
 
 		 122 aa  153  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2241  hypothetical protein  36.05 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001758  predicted membrane protein  31.97 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531472  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  29.56 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  37.18 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0810  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0629  protein of unknown function DUF805  31.21 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  30.08 
 
 		 386 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1123 aa  43.5  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  37.14 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00711  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  27.89 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  27.46 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  32.1 
 
 		 221 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0755  hypothetical protein  38.89 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0656  hypothetical protein  40.28 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00883836  decreased coverage  0.00160249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3162  hypothetical protein  29.6 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  31.65 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  31.65 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  31.65 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  31.65 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  32.88 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>