111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3234 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  100 
 
 
143 aa  278  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  41.67 
 
 
127 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  42.75 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  43.8 
 
 
125 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  41.22 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  41.13 
 
 
118 aa  94  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  41.13 
 
 
118 aa  94  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  41.13 
 
 
118 aa  94  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  41.13 
 
 
118 aa  94  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  41.13 
 
 
118 aa  94  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  41.13 
 
 
118 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  39.26 
 
 
126 aa  90.1  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  38.35 
 
 
122 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  35.54 
 
 
156 aa  87.8  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  40.48 
 
 
115 aa  88.2  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  39.2 
 
 
118 aa  87  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  39.2 
 
 
118 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  38.58 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  38.58 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  38.58 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  38.58 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  38.58 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  38.58 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1966  protein of unknown function DUF805  45.26 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  38.58 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  38.58 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  38.58 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  35.71 
 
 
123 aa  84.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  39.06 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  38.28 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  38.28 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  39.34 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  43.61 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  38.35 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  39.73 
 
 
200 aa  82  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  37.8 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  40.32 
 
 
146 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  37.13 
 
 
193 aa  80.5  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  41.94 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  36.22 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  40 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  36.22 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  36.43 
 
 
123 aa  77.4  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1013  hypothetical protein  38.06 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1841  protein of unknown function DUF805  37.31 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4114  protein of unknown function DUF805  41.51 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  40.52 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  38.58 
 
 
131 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  39.69 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  37.1 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  38.28 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  40.16 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2568  hypothetical protein  38.46 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000926681  normal  0.0635574 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3557  hypothetical protein  36.51 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  31.87 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  32.85 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2214  protein of unknown function DUF805  33.12 
 
 
215 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0656  hypothetical protein  35.11 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00883836  decreased coverage  0.00160249 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  32.19 
 
 
168 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  42.25 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0755  hypothetical protein  33.9 
 
 
109 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3495  inner membrane protein YhaH  37.9 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.573904  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3529  hypothetical protein  37.9 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.891346  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3425  inner membrane protein YhaH  37.9 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0469756  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3422  inner membrane protein YhaH  37.9 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4038  hypothetical protein  38.52 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511833  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3592  inner membrane protein YhaH  37.9 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.532788  normal  0.457416 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  30.63 
 
 
116 aa  58.9  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4205  hypothetical protein  35.54 
 
 
116 aa  57.8  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  38 
 
 
393 aa  57.4  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  31.45 
 
 
123 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  31.45 
 
 
123 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  31.45 
 
 
123 aa  57  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  31.45 
 
 
123 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  32.52 
 
 
386 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20900  predicted membrane protein  31.76 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.761588  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3187  protein of unknown function DUF805  33.08 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.658779  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  34.4 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2604  hypothetical protein  36.3 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462072 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  30.16 
 
 
221 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2599  protein of unknown function DUF805  37.78 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3455  hypothetical protein  36.27 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0992  hypothetical protein  36.36 
 
 
114 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2004  protein of unknown function DUF805  32.48 
 
 
125 aa  50.4  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0829  hypothetical protein  33.02 
 
 
194 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0175  hypothetical protein  32.56 
 
 
214 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1482  protein of unknown function DUF805  25.9 
 
 
371 aa  49.3  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.118245  normal  0.324958 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2197  protein of unknown function DUF805  29.37 
 
 
346 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  37.18 
 
 
318 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0427  hypothetical protein  31.96 
 
 
117 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.082341  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1470  hypothetical protein  28.7 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00332173  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4184  protein of unknown function DUF805  31.97 
 
 
173 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.150084  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0250  hypothetical protein  28.89 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121654 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3452  hypothetical protein  36.84 
 
 
68 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1691  hypothetical protein  26.32 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.554195  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03531  hypothetical protein  26.4 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1391  hypothetical protein  26.28 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0783489 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1521  hypothetical protein  30.21 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0995988  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  36.99 
 
 
360 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>