More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0430 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0430  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 230 aa  472  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  53.33 
 
 		 278 aa  88.6  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2546  hypothetical protein  44.23 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  48.89 
 
 		 961 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.22 
 
 		 811 aa  75.5  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.18 
 
 		 318 aa  75.1  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  45.33 
 
 		 490 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  45.33 
 
 		 490 aa  72.8  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  38.18 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  45.24 
 
 		 684 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  42.53 
 
 		 789 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  40.48 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  41.77 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  43.53 
 
 		 1402 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.76 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.77 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.68 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.71 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  38.82 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  42.68 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  42.53 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  44.44 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  40.23 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  41.67 
 
 		 831 aa  67  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  42.22 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  35.78 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  40 
 
 		 1493 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  42.53 
 
 		 838 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4631  protein of unknown function DUF805  37.27 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.276161  normal  0.187204 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.27 
 
 		 343 aa  65.1  0.0000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.26 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1674  hypothetical protein  34.83 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.71 
 
 		 1196 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  40.96 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2699  Sel1 domain-containing protein repeat-containing protein  37.33 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0148338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1680  Sel1 domain-containing protein  37.27 
 
 		 940 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.428252 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  35.85 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  36.56 
 
 		 978 aa  62.8  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  42.05 
 
 		 2413 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  37.93 
 
 		 1037 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  38.1 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  35.79 
 
 		 976 aa  62.8  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  36.78 
 
 		 557 aa  62.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  35.23 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  41.76 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  40.74 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  31.43 
 
 		 231 aa  62  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.216925 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.35 
 
 		 325 aa  62  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  39.29 
 
 		 208 aa  62  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  40.26 
 
 		 1877 aa  62  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  37.35 
 
 		 325 aa  62  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  32.26 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  38.64 
 
 		 552 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.62 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  37.65 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.94 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  39.08 
 
 		 685 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  39.08 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0597  Sel1 repeat-containing protein  32.17 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  32.29 
 
 		 1105 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0788  Sel1 domain-containing protein  32.95 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191842 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1532  Sel1 domain-containing protein  32.22 
 
 		 746 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00292625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.22 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  35.8 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  38.82 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  36.78 
 
 		 1430 aa  60.1  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  38.82 
 
 		 763 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  37.93 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.36 
 
 		 1012 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  39.02 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12370  hypothetical protein  39.02 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1430  Sel1 domain-containing protein  34.15 
 
 		 942 aa  59.3  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356598 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.08 
 
 		 1344 aa  59.3  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1130  hypothetical protein  40 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  35.29 
 
 		 731 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0920  Sel1 domain-containing protein  36.47 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  32.29 
 
 		 1059 aa  58.9  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  34.57 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  35.63 
 
 		 448 aa  58.9  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1002 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.51 
 
 		 346 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  38.75 
 
 		 380 aa  58.5  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09250  tetratricopeptide TPR-like helical protein  31.4 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  36.36 
 
 		 365 aa  58.5  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.84 
 
 		 321 aa  58.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  36.14 
 
 		 285 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  32.53 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  35.63 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4343  Sel1 repeat-containing protein  35.37 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  39.51 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.03 
 
 		 1110 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  34.38 
 
 		 1160 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  32.58 
 
 		 913 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  37.5 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3011  Sel1-like  36.71 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  38.16 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  36.78 
 
 		 679 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  40.23 
 
 		 850 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>