More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2245 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2245  putative protease  100 
 
 		 384 aa  795    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  47.45 
 
 		 461 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  56.6 
 
 		 473 aa  99.8  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.06 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  46.72 
 
 		 464 aa  97.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  47.83 
 
 		 464 aa  93.6  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  41.78 
 
 		 444 aa  93.6  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.44 
 
 		 450 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49223  predicted protein  31.23 
 
 		 447 aa  93.2  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.966771  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  46.28 
 
 		 480 aa  92.8  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0713  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.08 
 
 		 362 aa  92.8  9e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  54.21 
 
 		 476 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  38.67 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  42.54 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  43.24 
 
 		 480 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  42.54 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.04 
 
 		 410 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  50.47 
 
 		 475 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.11 
 
 		 474 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  44.53 
 
 		 466 aa  91.3  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46875  predicted protein  31.78 
 
 		 466 aa  90.5  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  52.33 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2210  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.8 
 
 		 319 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  38.41 
 
 		 376 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  46.55 
 
 		 458 aa  90.1  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3710  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.44 
 
 		 394 aa  90.1  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  46.55 
 
 		 457 aa  90.1  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  37.11 
 
 		 396 aa  89.7  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.65 
 
 		 384 aa  89.7  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  44.35 
 
 		 368 aa  89.7  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  47.62 
 
 		 476 aa  89.7  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2505  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.8 
 
 		 318 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  42.75 
 
 		 344 aa  89.4  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  40.71 
 
 		 500 aa  89.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  43.44 
 
 		 382 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  48.21 
 
 		 474 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  44.14 
 
 		 525 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  45.9 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  48.7 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0953  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.51 
 
 		 339 aa  89  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207331 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.21 
 
 		 474 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  48.18 
 
 		 318 aa  88.6  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31732  predicted protein  44 
 
 		 368 aa  88.2  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1879  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.13 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  43.18 
 
 		 420 aa  87.4  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.64 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  52.53 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  42.22 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1030  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.13 
 
 		 318 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  42.22 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0414  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.52 
 
 		 481 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  49.54 
 
 		 462 aa  87  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0415  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.52 
 
 		 483 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0386  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.52 
 
 		 484 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  43.08 
 
 		 513 aa  87  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2753  serine protease DO-like precursor  42.54 
 
 		 345 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  47.75 
 
 		 473 aa  87  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.75 
 
 		 417 aa  87  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  39.26 
 
 		 485 aa  87  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  38.57 
 
 		 375 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  44.44 
 
 		 476 aa  86.7  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  41.96 
 
 		 475 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  44.53 
 
 		 411 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  45.95 
 
 		 369 aa  86.7  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  42.5 
 
 		 461 aa  86.3  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  42.4 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  42.62 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03424  protease do  45.26 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1243  HtrA2 peptidase  42.22 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  41.22 
 
 		 511 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3020  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.43 
 
 		 324 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  44.03 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  42.5 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4302  2-alkenal reductase  49.55 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.519822 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0267  protease Do  44.53 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.326354  normal  0.464292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.47 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  41.06 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  46.67 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  45.38 
 
 		 525 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  44.36 
 
 		 527 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  41.8 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  40.77 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.46 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  43.44 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  40.3 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4948  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.78 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  44.35 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  42.5 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0912  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.27 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000212061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1164  protease Do  54.12 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0251777  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0630  putative serine protease  36.87 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677401  normal  0.0127211 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.98 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  36.71 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  43.55 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  38.93 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  42.86 
 
 		 481 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  43.17 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  42.75 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  39.57 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  50.52 
 
 		 485 aa  83.6  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>