More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49223 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_49223  predicted protein  100 
 
 
447 aa  910    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.966771  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46875  predicted protein  35.28 
 
 
466 aa  184  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  33.24 
 
 
469 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  33.42 
 
 
368 aa  167  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.42 
 
 
383 aa  166  6.9999999999999995e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  34.94 
 
 
383 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  33.07 
 
 
400 aa  163  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.24 
 
 
372 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  34.68 
 
 
383 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3562  predicted protein  38.75 
 
 
329 aa  161  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  34.43 
 
 
383 aa  160  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.18 
 
 
384 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  33.7 
 
 
375 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.78 
 
 
377 aa  156  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  33.93 
 
 
482 aa  155  9e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  37.46 
 
 
384 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  31.83 
 
 
418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  34.08 
 
 
480 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  32.06 
 
 
443 aa  154  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.19 
 
 
386 aa  153  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  30.73 
 
 
472 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  36.31 
 
 
473 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  35.35 
 
 
365 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  36.73 
 
 
375 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  34.9 
 
 
511 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  32.2 
 
 
374 aa  151  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  34.12 
 
 
399 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  32.9 
 
 
374 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  34.72 
 
 
453 aa  150  6e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  33.52 
 
 
418 aa  149  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  31.69 
 
 
403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  33.88 
 
 
513 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  33.88 
 
 
513 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  31.61 
 
 
483 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.59 
 
 
399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  32.77 
 
 
520 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.43 
 
 
674 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  34.49 
 
 
492 aa  147  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  33.77 
 
 
475 aa  146  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  35.92 
 
 
476 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  32.18 
 
 
471 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  43.59 
 
 
376 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  34 
 
 
396 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11001  serine protease pepD  33.72 
 
 
464 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000053367  normal  0.424973 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.04 
 
 
387 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  33.33 
 
 
413 aa  144  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  31.2 
 
 
483 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  32.74 
 
 
481 aa  143  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  31.2 
 
 
483 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  32.99 
 
 
452 aa  143  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  32.29 
 
 
385 aa  143  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.04 
 
 
388 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.37 
 
 
423 aa  143  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  33.15 
 
 
476 aa  142  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.63 
 
 
375 aa  142  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  33.43 
 
 
459 aa  142  9e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  31.16 
 
 
474 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  33.43 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  31.88 
 
 
479 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  32.12 
 
 
451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  32.94 
 
 
477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  32.94 
 
 
477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  31.86 
 
 
528 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  36.08 
 
 
552 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  31.45 
 
 
474 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  35.79 
 
 
382 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  30.36 
 
 
523 aa  141  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.48 
 
 
366 aa  141  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  36.75 
 
 
487 aa  141  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  36.97 
 
 
425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  32.12 
 
 
451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  36.27 
 
 
498 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.36 
 
 
440 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.36 
 
 
440 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.91 
 
 
471 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.36 
 
 
440 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  34.69 
 
 
472 aa  140  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31732  predicted protein  36.67 
 
 
368 aa  139  8.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  33.54 
 
 
459 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  31.45 
 
 
502 aa  139  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  33.57 
 
 
575 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  33.99 
 
 
374 aa  139  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  35.19 
 
 
508 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  34.14 
 
 
383 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  37.81 
 
 
496 aa  139  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  30.88 
 
 
393 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.15 
 
 
366 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  36.75 
 
 
497 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  31.08 
 
 
389 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  30.83 
 
 
485 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  31.11 
 
 
467 aa  138  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1243  HtrA2 peptidase  28.8 
 
 
453 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  33.24 
 
 
473 aa  137  3.0000000000000003e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  35.92 
 
 
522 aa  137  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  35.69 
 
 
498 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  37.46 
 
 
497 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.99 
 
 
381 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1889  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.33 
 
 
515 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  32.01 
 
 
476 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  34.15 
 
 
578 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>