More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0324 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  100 
 
 
413 aa  826    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1523  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  59.38 
 
 
421 aa  451  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.415135  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.02 
 
 
426 aa  285  7e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0552  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.62 
 
 
423 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0718  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.59 
 
 
424 aa  229  7e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.89 
 
 
366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  39.02 
 
 
425 aa  219  7e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.3 
 
 
368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  38.11 
 
 
389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  37.71 
 
 
368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  37.16 
 
 
459 aa  206  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  43.41 
 
 
344 aa  207  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  37.16 
 
 
459 aa  206  7e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.81 
 
 
387 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  39.33 
 
 
375 aa  202  7e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  37.23 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.26 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  34.22 
 
 
374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  36.74 
 
 
464 aa  197  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.18 
 
 
372 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  40.79 
 
 
469 aa  196  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  38.68 
 
 
400 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  38.78 
 
 
374 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  38.5 
 
 
384 aa  195  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.96 
 
 
394 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  37.58 
 
 
503 aa  194  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  38.31 
 
 
383 aa  193  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  38.03 
 
 
383 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  33.66 
 
 
374 aa  192  7e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  38.03 
 
 
383 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  36.93 
 
 
379 aa  192  9e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.03 
 
 
384 aa  192  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  37.8 
 
 
457 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  39.76 
 
 
464 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  37.94 
 
 
385 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  34.59 
 
 
491 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  37.81 
 
 
365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  40.48 
 
 
458 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  36.05 
 
 
400 aa  190  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  35.64 
 
 
409 aa  189  8e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.44 
 
 
386 aa  189  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  37.24 
 
 
473 aa  188  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  39.81 
 
 
453 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  38.66 
 
 
502 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0935  hypothetical protein  33.88 
 
 
363 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  37.87 
 
 
482 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.61 
 
 
377 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.93 
 
 
383 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0965  hypothetical protein  33.88 
 
 
363 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  32.92 
 
 
467 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  35.87 
 
 
453 aa  187  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  39.44 
 
 
503 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.74 
 
 
386 aa  187  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  40.58 
 
 
369 aa  186  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  35.33 
 
 
489 aa  186  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  35.12 
 
 
461 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  39.13 
 
 
503 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  34.65 
 
 
452 aa  186  7e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.58 
 
 
384 aa  186  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  37.94 
 
 
502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  37.94 
 
 
502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  37.94 
 
 
502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  36.65 
 
 
466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  37.94 
 
 
502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  39.32 
 
 
473 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  37.94 
 
 
502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  37.3 
 
 
504 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  37.94 
 
 
461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  37.94 
 
 
485 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  38.14 
 
 
507 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  38.91 
 
 
501 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  38.12 
 
 
505 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  36.41 
 
 
535 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  37.69 
 
 
487 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  38.5 
 
 
403 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  35 
 
 
473 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  37.62 
 
 
485 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  39.56 
 
 
418 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  37.85 
 
 
513 aa  183  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  36.62 
 
 
476 aa  183  6e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  39.41 
 
 
381 aa  183  6e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  36.98 
 
 
499 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  36.98 
 
 
498 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  39.64 
 
 
406 aa  182  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  38.49 
 
 
474 aa  182  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  36.98 
 
 
498 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  36.98 
 
 
499 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  36.98 
 
 
498 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  37.65 
 
 
511 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.25 
 
 
388 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  37.82 
 
 
505 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  35.94 
 
 
490 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  35.02 
 
 
504 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  37.98 
 
 
478 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  36.96 
 
 
480 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  37.81 
 
 
484 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  37.07 
 
 
520 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  38.91 
 
 
487 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  39.32 
 
 
418 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>