More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0552 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0552  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 423 aa  824    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.73 
 
 		 426 aa  318  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  43.5 
 
 		 413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1523  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.14 
 
 		 421 aa  263  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.415135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  41.21 
 
 		 344 aa  210  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  36.43 
 
 		 374 aa  206  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.33 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  37.87 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0718  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.31 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  38.02 
 
 		 389 aa  201  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  39.05 
 
 		 374 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  33.89 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.21 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  37.34 
 
 		 384 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  38.33 
 
 		 365 aa  196  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  36.71 
 
 		 376 aa  192  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.29 
 
 		 368 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  36.5 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.66 
 
 		 366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.54 
 
 		 372 aa  189  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  36.25 
 
 		 383 aa  189  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36 
 
 		 384 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  35.01 
 
 		 383 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  35.11 
 
 		 469 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.7 
 
 		 387 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  37.78 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  35.5 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.37 
 
 		 383 aa  184  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  36.7 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  32.8 
 
 		 503 aa  178  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.68 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.25 
 
 		 388 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  34.18 
 
 		 400 aa  176  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.42 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  38.46 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46875  predicted protein  34.96 
 
 		 466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  36.89 
 
 		 489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  35.7 
 
 		 375 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  35.95 
 
 		 418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  37.54 
 
 		 514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  35.95 
 
 		 409 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  37.24 
 
 		 514 aa  172  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  36.08 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  34.5 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  35.51 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  39.13 
 
 		 528 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  35.21 
 
 		 472 aa  169  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  39.08 
 
 		 537 aa  168  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  33.01 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.55 
 
 		 366 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5341  2-alkenal reductase  38.96 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  39.08 
 
 		 511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.14 
 
 		 367 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  37.3 
 
 		 419 aa  167  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5265  2-alkenal reductase  38.04 
 
 		 381 aa  167  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  35.09 
 
 		 379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0935  hypothetical protein  32.55 
 
 		 363 aa  166  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  37 
 
 		 459 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0965  hypothetical protein  32.64 
 
 		 363 aa  166  8e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.14 
 
 		 486 aa  166  9e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  37 
 
 		 459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  35.68 
 
 		 488 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.46 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4798  2-alkenal reductase  37.77 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  34.4 
 
 		 501 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  37.19 
 
 		 453 aa  164  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4575  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.93 
 
 		 375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  36.02 
 
 		 513 aa  162  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  36.06 
 
 		 516 aa  163  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.51 
 
 		 384 aa  162  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  38.22 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  34.74 
 
 		 471 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  32.91 
 
 		 474 aa  161  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  35.36 
 
 		 476 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  34.03 
 
 		 473 aa  160  5e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572701  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.39 
 
 		 381 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  37.54 
 
 		 511 aa  160  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.83 
 
 		 410 aa  160  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  33.51 
 
 		 464 aa  159  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  35.19 
 
 		 501 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  34.86 
 
 		 388 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  34.57 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  35.52 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  36.67 
 
 		 407 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  35.31 
 
 		 487 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  34.32 
 
 		 484 aa  157  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0658  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.38 
 
 		 434 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  33.56 
 
 		 502 aa  157  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  36.5 
 
 		 464 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.96 
 
 		 487 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5907  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.81 
 
 		 424 aa  156  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  35.06 
 
 		 503 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  32.17 
 
 		 476 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  36.22 
 
 		 498 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12778  serine protease precursor  34.52 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  34.23 
 
 		 498 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  34.23 
 
 		 498 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  31.84 
 
 		 474 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  34.23 
 
 		 498 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  34.45 
 
 		 524 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>