More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0614 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  97.91 
 
 		 383 aa  746    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  100 
 
 		 383 aa  764    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  95.81 
 
 		 383 aa  731    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  90.34 
 
 		 384 aa  691    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  93.47 
 
 		 384 aa  717    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  64.77 
 
 		 375 aa  472  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  68.01 
 
 		 365 aa  458  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  68.25 
 
 		 377 aa  454  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  63.03 
 
 		 374 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  59.83 
 
 		 374 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  53.02 
 
 		 368 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.66 
 
 		 372 aa  316  5e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  56.04 
 
 		 344 aa  315  9e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  53.92 
 
 		 469 aa  311  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  48.53 
 
 		 375 aa  292  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  48.92 
 
 		 376 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  50.6 
 
 		 383 aa  289  6e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.7 
 
 		 387 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5265  2-alkenal reductase  49.61 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4798  2-alkenal reductase  49.61 
 
 		 381 aa  277  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.14 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  49.32 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5341  2-alkenal reductase  49.35 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.49 
 
 		 366 aa  272  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.47 
 
 		 368 aa  269  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4575  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.72 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46875  predicted protein  45.03 
 
 		 466 aa  255  8e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3562  predicted protein  45.29 
 
 		 329 aa  245  9e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2947  2-alkenal reductase  48.77 
 
 		 374 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.24 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.2 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  40.4 
 
 		 374 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0965  hypothetical protein  42.64 
 
 		 363 aa  233  6e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0935  hypothetical protein  42.34 
 
 		 363 aa  232  7.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  43.11 
 
 		 396 aa  232  7.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31732  predicted protein  41.67 
 
 		 368 aa  228  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  42.18 
 
 		 425 aa  227  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  43.07 
 
 		 389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  42.12 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  41.07 
 
 		 418 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.48 
 
 		 426 aa  216  7e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  41.89 
 
 		 418 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  45.2 
 
 		 467 aa  209  7e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  44.59 
 
 		 511 aa  209  9e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  39.28 
 
 		 403 aa  206  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  37.54 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.19 
 
 		 387 aa  203  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  44.56 
 
 		 456 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  36.22 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.54 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  44.76 
 
 		 462 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  44.56 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  37.31 
 
 		 453 aa  197  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  40.7 
 
 		 452 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.48 
 
 		 379 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  45.1 
 
 		 455 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  44.14 
 
 		 489 aa  196  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  42.61 
 
 		 492 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  42.61 
 
 		 492 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  44.36 
 
 		 492 aa  196  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.86 
 
 		 398 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  45.61 
 
 		 450 aa  195  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  45.61 
 
 		 450 aa  195  9e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  44.64 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  45.61 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  38.51 
 
 		 458 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.05 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  39.8 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  43.86 
 
 		 456 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  40.69 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  42.19 
 
 		 483 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  42.19 
 
 		 483 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  44.91 
 
 		 451 aa  193  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  40.69 
 
 		 408 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  35.04 
 
 		 403 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  42.86 
 
 		 504 aa  193  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  35.71 
 
 		 453 aa  193  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  43.46 
 
 		 514 aa  193  5e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  42.4 
 
 		 483 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  41.4 
 
 		 484 aa  192  6e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  41.16 
 
 		 379 aa  192  7e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  38.03 
 
 		 413 aa  192  7e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  41.34 
 
 		 457 aa  192  8e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.79 
 
 		 385 aa  192  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  39.73 
 
 		 459 aa  192  8e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.48 
 
 		 381 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  43.46 
 
 		 514 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  39.73 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  43.21 
 
 		 385 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  41.72 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  42.61 
 
 		 535 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  42.47 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.06 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  41.2 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  44.91 
 
 		 450 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  44.91 
 
 		 450 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  44.91 
 
 		 450 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  37.74 
 
 		 400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  43.77 
 
 		 495 aa  190  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  41.55 
 
 		 503 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>