More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1850 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  100 
 
 
535 aa  1049    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0052  serine protease  43.57 
 
 
483 aa  333  4e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  40.47 
 
 
506 aa  304  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  40.94 
 
 
498 aa  298  1e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  44.75 
 
 
472 aa  293  6e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  46.8 
 
 
508 aa  292  9e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0209  protease Do  37.95 
 
 
517 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0976741 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  38.89 
 
 
490 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  39.71 
 
 
503 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  39.57 
 
 
513 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  39.15 
 
 
511 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  39.5 
 
 
503 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  38.51 
 
 
512 aa  286  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  36.86 
 
 
485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  36.81 
 
 
502 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  36.81 
 
 
461 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  36.81 
 
 
485 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  36.81 
 
 
502 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  36.81 
 
 
502 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0019  protease Do  35.85 
 
 
466 aa  285  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.822523  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  36.81 
 
 
502 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  36.81 
 
 
502 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  36.69 
 
 
498 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  36.69 
 
 
498 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  36.69 
 
 
498 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  36.03 
 
 
491 aa  283  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  36.69 
 
 
499 aa  281  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  36.48 
 
 
500 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  36.69 
 
 
499 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.28 
 
 
475 aa  278  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  38.86 
 
 
471 aa  278  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  39.35 
 
 
505 aa  277  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  39.1 
 
 
502 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  37.29 
 
 
502 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  37.53 
 
 
473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  37.74 
 
 
476 aa  274  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  41.82 
 
 
473 aa  274  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  39.44 
 
 
505 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  46.93 
 
 
393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  43.48 
 
 
396 aa  273  5.000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  39.69 
 
 
507 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  39.06 
 
 
478 aa  273  6e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0618  hypothetical protein  36.44 
 
 
503 aa  271  2e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  37.5 
 
 
501 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  37.96 
 
 
496 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  38.46 
 
 
500 aa  271  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  39.36 
 
 
497 aa  270  4e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  43.77 
 
 
392 aa  270  4e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  38.82 
 
 
493 aa  269  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  48.48 
 
 
471 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  36.69 
 
 
489 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  38.95 
 
 
476 aa  269  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  35.11 
 
 
475 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  38.51 
 
 
476 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  37.94 
 
 
461 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  40.72 
 
 
489 aa  268  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  37.47 
 
 
477 aa  268  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  37.47 
 
 
477 aa  268  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  38.92 
 
 
504 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  37.74 
 
 
511 aa  268  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  37.63 
 
 
498 aa  267  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  38.99 
 
 
479 aa  267  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  37.28 
 
 
472 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  39.27 
 
 
518 aa  266  8.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  36.44 
 
 
514 aa  266  8.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  42.2 
 
 
452 aa  265  1e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  43.47 
 
 
504 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  40.74 
 
 
474 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  36.91 
 
 
476 aa  263  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  37.47 
 
 
473 aa  263  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  37.58 
 
 
482 aa  264  4e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12778  serine protease precursor  43.04 
 
 
467 aa  263  4.999999999999999e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  38.66 
 
 
516 aa  263  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2092  protease Do  37.73 
 
 
471 aa  263  8e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  38.53 
 
 
506 aa  262  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  40.74 
 
 
474 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  36.02 
 
 
488 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  38.17 
 
 
476 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  46.73 
 
 
385 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  40.75 
 
 
450 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  40.75 
 
 
450 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  40.75 
 
 
450 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  47.21 
 
 
499 aa  261  3e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.26 
 
 
390 aa  260  4e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  38.82 
 
 
476 aa  260  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  36.08 
 
 
514 aa  260  5.0000000000000005e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  39.51 
 
 
451 aa  259  6e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  37.12 
 
 
474 aa  259  8e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  41.48 
 
 
474 aa  259  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  35.81 
 
 
491 aa  259  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  38.55 
 
 
490 aa  259  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  36.38 
 
 
501 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  38.21 
 
 
482 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  37.91 
 
 
464 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  47.83 
 
 
473 aa  257  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  38.18 
 
 
509 aa  258  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  39.64 
 
 
460 aa  258  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  47.27 
 
 
383 aa  257  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  37.2 
 
 
487 aa  257  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  47.15 
 
 
469 aa  256  5e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>