More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3737 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 399 aa  804    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  46.47 
 
 		 425 aa  279  5e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  43.13 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  43.7 
 
 		 469 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  45.16 
 
 		 374 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.77 
 
 		 372 aa  246  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.5 
 
 		 366 aa  244  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  44.27 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.2 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  43.5 
 
 		 384 aa  239  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  43.5 
 
 		 383 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  43.5 
 
 		 383 aa  239  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  43.33 
 
 		 399 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  43.2 
 
 		 383 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.17 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.04 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.94 
 
 		 377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  42.6 
 
 		 365 aa  229  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  41.36 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  39.82 
 
 		 374 aa  228  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.99 
 
 		 387 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  39.77 
 
 		 375 aa  224  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.17 
 
 		 383 aa  222  8e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  40.18 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.1 
 
 		 394 aa  219  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  42.6 
 
 		 344 aa  219  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.88 
 
 		 366 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  37.08 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.36 
 
 		 387 aa  215  9e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  38.83 
 
 		 376 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.14 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  37.26 
 
 		 418 aa  210  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  41.89 
 
 		 594 aa  209  7e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  42.67 
 
 		 673 aa  207  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2947  2-alkenal reductase  40.66 
 
 		 374 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  39.64 
 
 		 395 aa  204  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  37.31 
 
 		 400 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  34.87 
 
 		 403 aa  202  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3562  predicted protein  39.64 
 
 		 329 aa  202  9e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  40.54 
 
 		 535 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  39.39 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0935  hypothetical protein  35.86 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  39.24 
 
 		 584 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.86 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  40.26 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0965  hypothetical protein  36.12 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5265  2-alkenal reductase  40.17 
 
 		 381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31732  predicted protein  41.44 
 
 		 368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4798  2-alkenal reductase  40.17 
 
 		 381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  39.32 
 
 		 379 aa  199  9e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46875  predicted protein  37.75 
 
 		 466 aa  198  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  34.69 
 
 		 369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  40.07 
 
 		 511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.22 
 
 		 423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  39.74 
 
 		 513 aa  196  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  36.96 
 
 		 418 aa  196  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  38.49 
 
 		 472 aa  195  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  35.94 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5341  2-alkenal reductase  41.32 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  39.27 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.1 
 
 		 384 aa  193  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  39.38 
 
 		 511 aa  192  8e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  40.27 
 
 		 455 aa  192  9e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  37.25 
 
 		 459 aa  192  9e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  38.75 
 
 		 409 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0019  protease Do  37.5 
 
 		 466 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.822523  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.14 
 
 		 381 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  37.25 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  39.54 
 
 		 552 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  39.07 
 
 		 413 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  38.67 
 
 		 471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  34.07 
 
 		 389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  37.65 
 
 		 614 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  38.24 
 
 		 472 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  39.13 
 
 		 412 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  39.33 
 
 		 404 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12778  serine protease precursor  38.01 
 
 		 467 aa  189  5.999999999999999e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  40.26 
 
 		 483 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  38.85 
 
 		 462 aa  189  8e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.92 
 
 		 408 aa  189  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  40.07 
 
 		 483 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  39.65 
 
 		 385 aa  189  8e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  40.14 
 
 		 471 aa  189  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  40.26 
 
 		 483 aa  189  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1435  peptidase S1C, Do  37.79 
 
 		 545 aa  189  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.600827 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  38.33 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  38.54 
 
 		 423 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  40.48 
 
 		 462 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0535  2-alkenal reductase  36.46 
 
 		 469 aa  188  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.227386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  39 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  38.38 
 
 		 451 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  39.26 
 
 		 467 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.67 
 
 		 486 aa  187  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  38.38 
 
 		 455 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  38.38 
 
 		 455 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  38.38 
 
 		 455 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  38.38 
 
 		 455 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.07 
 
 		 545 aa  187  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0731  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.91 
 
 		 407 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.415998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.88 
 
 		 375 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>