More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0558 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  100 
 
 
368 aa  743    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  57.5 
 
 
375 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  53.74 
 
 
374 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  53.68 
 
 
383 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  53.02 
 
 
383 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  53.57 
 
 
384 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  57.23 
 
 
377 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  53.3 
 
 
383 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.3 
 
 
384 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  57.27 
 
 
365 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  52.77 
 
 
374 aa  355  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.52 
 
 
372 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  51.93 
 
 
469 aa  340  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.67 
 
 
383 aa  316  4e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  50.59 
 
 
375 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  50 
 
 
344 aa  297  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.92 
 
 
368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  46.81 
 
 
376 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.22 
 
 
366 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3562  predicted protein  48.1 
 
 
329 aa  270  4e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46875  predicted protein  43.1 
 
 
466 aa  268  8.999999999999999e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.84 
 
 
388 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.92 
 
 
387 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4575  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.42 
 
 
375 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  44.32 
 
 
399 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5265  2-alkenal reductase  47.41 
 
 
381 aa  260  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4798  2-alkenal reductase  47.41 
 
 
381 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.72 
 
 
366 aa  260  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2947  2-alkenal reductase  46.6 
 
 
374 aa  259  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5341  2-alkenal reductase  46.67 
 
 
381 aa  256  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0935  hypothetical protein  41.59 
 
 
363 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0965  hypothetical protein  41.59 
 
 
363 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31732  predicted protein  42.56 
 
 
368 aa  248  2e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  44.58 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  42.01 
 
 
374 aa  230  3e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.07 
 
 
394 aa  226  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  36.58 
 
 
389 aa  226  7e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  39.69 
 
 
379 aa  224  2e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  42.64 
 
 
418 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  45.24 
 
 
418 aa  222  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.88 
 
 
387 aa  223  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.18 
 
 
399 aa  221  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  41.46 
 
 
381 aa  217  2e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  40.31 
 
 
425 aa  216  5.9999999999999996e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.38 
 
 
426 aa  215  8e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  37.71 
 
 
413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  45.94 
 
 
511 aa  208  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  42.71 
 
 
400 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  42.06 
 
 
535 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  40.19 
 
 
341 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  36.31 
 
 
464 aa  204  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  38.28 
 
 
467 aa  203  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  36.48 
 
 
476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  39.51 
 
 
476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  38.3 
 
 
465 aa  200  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  39.51 
 
 
476 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.97 
 
 
381 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  37.54 
 
 
453 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  39.72 
 
 
503 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  40.8 
 
 
498 aa  196  5.000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  36.26 
 
 
393 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  40.88 
 
 
476 aa  196  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1523  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.41 
 
 
421 aa  196  8.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.415135  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  37.1 
 
 
369 aa  195  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  38.19 
 
 
403 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  34.63 
 
 
459 aa  195  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  34.9 
 
 
474 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.61 
 
 
450 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  34.63 
 
 
474 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  38.73 
 
 
487 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  35.86 
 
 
471 aa  193  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  34.63 
 
 
459 aa  194  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  38.01 
 
 
481 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.07 
 
 
375 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  40.28 
 
 
456 aa  193  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  41.55 
 
 
318 aa  193  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  38.87 
 
 
496 aa  193  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  39.94 
 
 
347 aa  192  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  37.7 
 
 
472 aa  192  6e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  37.81 
 
 
493 aa  192  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  36.34 
 
 
473 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  40.66 
 
 
458 aa  192  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  40.59 
 
 
458 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0552  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.15 
 
 
423 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0052  serine protease  40.35 
 
 
483 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  39.09 
 
 
457 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  37.81 
 
 
491 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  37.85 
 
 
408 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  41.64 
 
 
483 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  39.33 
 
 
511 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  41.64 
 
 
483 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  41.78 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.36 
 
 
387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  34.47 
 
 
504 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  38.16 
 
 
490 aa  190  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  38.24 
 
 
408 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.32 
 
 
379 aa  190  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  40.07 
 
 
477 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  38.52 
 
 
516 aa  190  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  39.35 
 
 
453 aa  190  4e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>