More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0758 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
375 aa  754    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  49.46 
 
 
382 aa  349  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  50.67 
 
 
379 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.55 
 
 
381 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.67 
 
 
386 aa  334  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  47.63 
 
 
369 aa  334  2e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.73 
 
 
384 aa  330  3e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.62 
 
 
386 aa  322  5e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  46.39 
 
 
400 aa  286  4e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  46.93 
 
 
500 aa  279  7e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  46.37 
 
 
474 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  45.35 
 
 
408 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  45.05 
 
 
408 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  45.4 
 
 
411 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  42.86 
 
 
452 aa  271  1e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  42.69 
 
 
482 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  41.8 
 
 
471 aa  269  8e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  43.63 
 
 
476 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  46.71 
 
 
415 aa  266  4e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  42.57 
 
 
481 aa  265  8e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.95 
 
 
428 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  46.06 
 
 
424 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  44.51 
 
 
388 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  44.23 
 
 
476 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  44.62 
 
 
478 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  40.28 
 
 
476 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  43.95 
 
 
476 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  43.96 
 
 
472 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  40.64 
 
 
473 aa  258  9e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  41.5 
 
 
476 aa  257  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  46.58 
 
 
475 aa  257  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  43.83 
 
 
391 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  43.03 
 
 
396 aa  255  7e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  43.73 
 
 
402 aa  255  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  43.73 
 
 
402 aa  255  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.94 
 
 
401 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  40.17 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  44.9 
 
 
465 aa  251  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  43.64 
 
 
402 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  41.37 
 
 
475 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  41.93 
 
 
406 aa  251  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  43.61 
 
 
457 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  43.31 
 
 
453 aa  250  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  42.26 
 
 
464 aa  250  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  43.54 
 
 
411 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  41.64 
 
 
383 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  46.99 
 
 
466 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  43.06 
 
 
497 aa  245  9e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  36.9 
 
 
503 aa  243  3e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  43.81 
 
 
480 aa  244  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  41.8 
 
 
402 aa  243  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  42.15 
 
 
393 aa  243  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  40.4 
 
 
387 aa  243  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  40.37 
 
 
397 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  44.17 
 
 
464 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  40.37 
 
 
383 aa  242  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.36 
 
 
405 aa  242  7.999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.11 
 
 
379 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  40 
 
 
479 aa  240  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  41.69 
 
 
461 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  39.83 
 
 
388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  41.42 
 
 
394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  39.83 
 
 
402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.1 
 
 
412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  39.35 
 
 
489 aa  239  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.34 
 
 
401 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  42.09 
 
 
453 aa  239  4e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  41.34 
 
 
401 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.34 
 
 
401 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  40 
 
 
469 aa  239  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  41.34 
 
 
401 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  39.83 
 
 
402 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  39.83 
 
 
402 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  39.83 
 
 
402 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  39.83 
 
 
402 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.34 
 
 
401 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  41.67 
 
 
500 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  38.6 
 
 
495 aa  238  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  38.87 
 
 
514 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  41.9 
 
 
477 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.03 
 
 
401 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  39.64 
 
 
493 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  39.29 
 
 
578 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.24 
 
 
410 aa  236  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  38.42 
 
 
505 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  38.53 
 
 
588 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  41.09 
 
 
535 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  39.54 
 
 
388 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  39.05 
 
 
506 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  41.28 
 
 
459 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  40.8 
 
 
494 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  42.06 
 
 
489 aa  235  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  41.28 
 
 
459 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  43.93 
 
 
458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  38.28 
 
 
487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  39.05 
 
 
493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  38.91 
 
 
362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  39.05 
 
 
485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  40.6 
 
 
473 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  41.87 
 
 
389 aa  234  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>