More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0052 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0052  serine protease  100 
 
 		 483 aa  971    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292411 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0618  hypothetical protein  50.9 
 
 		 503 aa  434  1e-120  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  45.92 
 
 		 508 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  45.82 
 
 		 506 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  46.19 
 
 		 498 aa  376  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  47.42 
 
 		 512 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  45.31 
 
 		 472 aa  361  2e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0209  protease Do  42.39 
 
 		 517 aa  345  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0976741 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  43.57 
 
 		 535 aa  334  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2092  protease Do  44.66 
 
 		 471 aa  332  9e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12778  serine protease precursor  40.33 
 
 		 467 aa  324  2e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0019  protease Do  41.69 
 
 		 466 aa  303  4.0000000000000003e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.822523  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  46.72 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  46.72 
 
 		 388 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  46.72 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  46.72 
 
 		 402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  46.44 
 
 		 402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  46.44 
 
 		 402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  46.44 
 
 		 402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  37.67 
 
 		 469 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.75 
 
 		 401 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  46.15 
 
 		 388 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  36.53 
 
 		 511 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  46.45 
 
 		 401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.45 
 
 		 401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  46.59 
 
 		 402 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  46.45 
 
 		 401 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  45.56 
 
 		 407 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.45 
 
 		 401 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.45 
 
 		 401 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  45.51 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  45.1 
 
 		 407 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  42.78 
 
 		 398 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.6 
 
 		 398 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  39.39 
 
 		 476 aa  266  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  42.3 
 
 		 396 aa  266  7e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  44.11 
 
 		 403 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  40.98 
 
 		 473 aa  264  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  44.58 
 
 		 404 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  34.69 
 
 		 473 aa  263  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  39.31 
 
 		 460 aa  263  6e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  38.35 
 
 		 500 aa  262  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  39.44 
 
 		 497 aa  261  2e-68  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  44.28 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  35.9 
 
 		 502 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.55 
 
 		 380 aa  259  7e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  36.67 
 
 		 474 aa  257  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  35.65 
 
 		 513 aa  256  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  36.54 
 
 		 474 aa  256  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  34.22 
 
 		 481 aa  256  9e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  36.54 
 
 		 474 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  39.2 
 
 		 511 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  38 
 
 		 474 aa  254  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  37.79 
 
 		 489 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  44.72 
 
 		 456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  38.5 
 
 		 508 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  37.36 
 
 		 505 aa  253  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  37.21 
 
 		 499 aa  253  6e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  43.48 
 
 		 446 aa  253  7e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  37.53 
 
 		 504 aa  253  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  37.08 
 
 		 487 aa  253  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  45.06 
 
 		 450 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  37.53 
 
 		 471 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  36.73 
 
 		 465 aa  252  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  37.5 
 
 		 474 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  37.08 
 
 		 504 aa  251  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  37.26 
 
 		 490 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  40.66 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  36.6 
 
 		 484 aa  251  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  40.66 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  40.66 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  39.17 
 
 		 449 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  38.15 
 
 		 505 aa  250  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.81 
 
 		 379 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  37.84 
 
 		 472 aa  250  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  38.37 
 
 		 503 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  36.64 
 
 		 475 aa  250  5e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  42.26 
 
 		 457 aa  249  6e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  34.95 
 
 		 494 aa  249  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.94 
 
 		 396 aa  249  8e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  35.19 
 
 		 493 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  35.19 
 
 		 493 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  35.55 
 
 		 503 aa  249  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  38.89 
 
 		 456 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  33.72 
 
 		 477 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  38.12 
 
 		 498 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  38.13 
 
 		 503 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  36.36 
 
 		 506 aa  249  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.1 
 
 		 417 aa  249  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  42.9 
 
 		 386 aa  249  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  45.06 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  45.06 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  44.44 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  45.06 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  35.6 
 
 		 491 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  38.35 
 
 		 457 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  38.35 
 
 		 457 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  38.04 
 
 		 478 aa  247  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  33.64 
 
 		 473 aa  247  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  38.46 
 
 		 496 aa  247  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>