More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5949 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  100 
 
 
512 aa  1028    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  47.36 
 
 
506 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0052  serine protease  47.42 
 
 
483 aa  375  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292411 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0618  hypothetical protein  42.69 
 
 
503 aa  374  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  45.43 
 
 
508 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0209  protease Do  43.22 
 
 
517 aa  330  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0976741 
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  44.59 
 
 
498 aa  325  1e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  43.55 
 
 
472 aa  309  9e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2092  protease Do  41.13 
 
 
471 aa  293  6e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  38.51 
 
 
535 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0019  protease Do  38.26 
 
 
466 aa  282  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.822523  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12778  serine protease precursor  36.73 
 
 
467 aa  268  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  40.62 
 
 
467 aa  251  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  36.93 
 
 
497 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  39.34 
 
 
473 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  35.84 
 
 
500 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  37.91 
 
 
511 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  37.44 
 
 
471 aa  243  5e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  37.44 
 
 
396 aa  243  6e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  41.16 
 
 
474 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  41.46 
 
 
474 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  36.61 
 
 
474 aa  240  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  36.61 
 
 
474 aa  240  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.36 
 
 
385 aa  240  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  36.61 
 
 
474 aa  240  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  36.61 
 
 
474 aa  240  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  36.61 
 
 
474 aa  240  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  36.61 
 
 
474 aa  240  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  36.61 
 
 
474 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  39.48 
 
 
499 aa  240  5.999999999999999e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.56 
 
 
380 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  38 
 
 
392 aa  239  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  36.57 
 
 
496 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  40.19 
 
 
506 aa  239  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  36.38 
 
 
474 aa  239  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.01 
 
 
379 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  33.53 
 
 
502 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.41 
 
 
388 aa  237  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  34.23 
 
 
504 aa  237  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  42.73 
 
 
505 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.52 
 
 
384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  33.14 
 
 
514 aa  236  6e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  35.06 
 
 
469 aa  236  6e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  39.41 
 
 
502 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  37.53 
 
 
476 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  34.49 
 
 
473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  33.14 
 
 
514 aa  234  3e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  36.45 
 
 
476 aa  234  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  46.15 
 
 
386 aa  234  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  41.37 
 
 
386 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  35.76 
 
 
488 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.93 
 
 
390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00159  hypothetical protein  36.16 
 
 
474 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  37.44 
 
 
478 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  37.44 
 
 
478 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  37.44 
 
 
475 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  41.42 
 
 
385 aa  233  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  37.44 
 
 
475 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  37.44 
 
 
475 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  35.62 
 
 
487 aa  233  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  36.24 
 
 
476 aa  232  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  41.37 
 
 
386 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  35.94 
 
 
479 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  37.68 
 
 
481 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  40.4 
 
 
383 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.97 
 
 
396 aa  232  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  37.1 
 
 
472 aa  231  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  45.45 
 
 
383 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  35.55 
 
 
476 aa  231  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  36.84 
 
 
495 aa  231  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  35.37 
 
 
493 aa  231  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  36.83 
 
 
508 aa  231  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  37.73 
 
 
462 aa  231  3e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  41.07 
 
 
402 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  39.66 
 
 
492 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  41.07 
 
 
386 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  34.86 
 
 
476 aa  229  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  37 
 
 
513 aa  229  7e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  36.14 
 
 
479 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  37.71 
 
 
472 aa  229  7e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  43.92 
 
 
379 aa  229  8e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  36.01 
 
 
491 aa  229  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  37.71 
 
 
472 aa  229  9e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  34.01 
 
 
476 aa  229  9e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  36.74 
 
 
477 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  41.71 
 
 
393 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  35.15 
 
 
506 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  35.83 
 
 
484 aa  228  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  35.84 
 
 
477 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  40.88 
 
 
404 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  42.18 
 
 
504 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  38.14 
 
 
466 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  36.67 
 
 
502 aa  228  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  41.11 
 
 
404 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  35.32 
 
 
511 aa  227  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  42.04 
 
 
403 aa  226  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  37.76 
 
 
464 aa  226  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 
478 aa  226  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  36.06 
 
 
501 aa  226  9e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  42.94 
 
 
498 aa  225  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>