More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5515 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  100 
 
 		 383 aa  757    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  79.9 
 
 		 379 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  79.9 
 
 		 379 aa  593  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  76.74 
 
 		 385 aa  563  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  75.6 
 
 		 380 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  75.67 
 
 		 386 aa  545  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  73.08 
 
 		 388 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  71.58 
 
 		 384 aa  511  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  62.79 
 
 		 386 aa  464  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  61.15 
 
 		 398 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  61.05 
 
 		 398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  61.3 
 
 		 403 aa  448  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  60.78 
 
 		 404 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  60.78 
 
 		 404 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  57.51 
 
 		 407 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  57.76 
 
 		 402 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  56.93 
 
 		 407 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  56.39 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  56.82 
 
 		 402 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  56.44 
 
 		 383 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  56.64 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  57.07 
 
 		 402 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.64 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  56.71 
 
 		 403 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  57.07 
 
 		 402 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  56.82 
 
 		 402 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  56.82 
 
 		 402 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.64 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.39 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.64 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  58.44 
 
 		 383 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  55.84 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  57.44 
 
 		 387 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  56.92 
 
 		 388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  56.4 
 
 		 388 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.59 
 
 		 390 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  53.75 
 
 		 396 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.69 
 
 		 396 aa  391  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  55.36 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  56.02 
 
 		 385 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  55.45 
 
 		 412 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  55.45 
 
 		 385 aa  348  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  53.69 
 
 		 380 aa  346  5e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  54.28 
 
 		 386 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  54.28 
 
 		 402 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  54.28 
 
 		 386 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  54.44 
 
 		 386 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.84 
 
 		 385 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  53.59 
 
 		 389 aa  338  7e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.89 
 
 		 408 aa  338  8e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  51.7 
 
 		 389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.96 
 
 		 417 aa  335  5.999999999999999e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  53.85 
 
 		 386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  53.35 
 
 		 383 aa  324  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  53.55 
 
 		 386 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  46.09 
 
 		 513 aa  306  4.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  51.72 
 
 		 372 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  50.48 
 
 		 465 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.76 
 
 		 391 aa  295  9e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.21 
 
 		 387 aa  295  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  48.61 
 
 		 443 aa  293  3e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  46.54 
 
 		 496 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  48.16 
 
 		 474 aa  286  5e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  48.16 
 
 		 474 aa  286  5e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  49.23 
 
 		 471 aa  281  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  48.74 
 
 		 463 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  52.08 
 
 		 460 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  46.93 
 
 		 468 aa  280  4e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  43.33 
 
 		 350 aa  279  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  46.52 
 
 		 464 aa  279  7e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  45.89 
 
 		 464 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  47.65 
 
 		 467 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  48.58 
 
 		 463 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  43.27 
 
 		 467 aa  277  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  46.54 
 
 		 464 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.71 
 
 		 442 aa  276  4e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  46.54 
 
 		 442 aa  275  9e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  51.33 
 
 		 476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  49.84 
 
 		 453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  48.14 
 
 		 457 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  47.09 
 
 		 449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  45.17 
 
 		 478 aa  273  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  50 
 
 		 393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  46.83 
 
 		 450 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  47.96 
 
 		 450 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  47.59 
 
 		 450 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  47.59 
 
 		 450 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  47.96 
 
 		 450 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  47.96 
 
 		 450 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  48.38 
 
 		 449 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  45.37 
 
 		 472 aa  271  2e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  48.19 
 
 		 451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  47.59 
 
 		 450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  47.73 
 
 		 450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  46.5 
 
 		 476 aa  270  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  49.37 
 
 		 450 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  47.66 
 
 		 485 aa  269  5e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  51.16 
 
 		 471 aa  269  5.9999999999999995e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  47.73 
 
 		 451 aa  269  7e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  46.71 
 
 		 450 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>