More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3620 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3620  protease Do  100 
 
 
495 aa  984    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  41.72 
 
 
498 aa  310  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  37.84 
 
 
520 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  41.14 
 
 
491 aa  295  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  41.04 
 
 
464 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  39.96 
 
 
487 aa  290  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  39.46 
 
 
457 aa  289  8e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  43.96 
 
 
537 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  39.43 
 
 
502 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  39.43 
 
 
502 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  39.43 
 
 
502 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  39.43 
 
 
485 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  39.21 
 
 
476 aa  286  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  39.43 
 
 
502 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  39.43 
 
 
502 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  37.42 
 
 
476 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  38.93 
 
 
472 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  39.43 
 
 
461 aa  286  7e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  38.79 
 
 
471 aa  286  8e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  39.2 
 
 
503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  37.35 
 
 
502 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  38.48 
 
 
485 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  38.56 
 
 
485 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  40.72 
 
 
461 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  40.22 
 
 
503 aa  282  9e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  42 
 
 
474 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  38.49 
 
 
500 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  42.79 
 
 
504 aa  281  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  40.08 
 
 
476 aa  281  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  39.84 
 
 
493 aa  281  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  40.47 
 
 
473 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  41.76 
 
 
474 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  40.65 
 
 
498 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  40.4 
 
 
488 aa  280  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  36.36 
 
 
476 aa  280  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  38.07 
 
 
490 aa  280  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  39.43 
 
 
484 aa  279  7e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  39.88 
 
 
490 aa  279  7e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  39 
 
 
497 aa  279  8e-74  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  37.13 
 
 
506 aa  279  8e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  38.32 
 
 
523 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  40.04 
 
 
469 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  39.1 
 
 
493 aa  278  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  38.31 
 
 
478 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  39.02 
 
 
488 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  41.73 
 
 
479 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  38.74 
 
 
464 aa  277  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  37.14 
 
 
479 aa  276  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  39.11 
 
 
508 aa  276  5e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  38.97 
 
 
513 aa  276  7e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  38.97 
 
 
513 aa  276  7e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  39.39 
 
 
505 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  38.89 
 
 
473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  41.45 
 
 
477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  37.31 
 
 
505 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  37.55 
 
 
501 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  39.91 
 
 
509 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  39.13 
 
 
490 aa  273  6e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  37.56 
 
 
502 aa  273  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  41.2 
 
 
477 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  36.91 
 
 
499 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  36.91 
 
 
499 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  38.61 
 
 
492 aa  273  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  38.61 
 
 
492 aa  273  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  38.56 
 
 
509 aa  273  7e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  39.53 
 
 
487 aa  272  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  36.62 
 
 
500 aa  272  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  40.96 
 
 
492 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  41.12 
 
 
474 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  37.86 
 
 
491 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  36.63 
 
 
498 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  36.63 
 
 
498 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  39.58 
 
 
458 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  36.63 
 
 
498 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  41.01 
 
 
479 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  38.09 
 
 
474 aa  271  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  39.55 
 
 
460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  38 
 
 
523 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  38.75 
 
 
513 aa  270  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  39.82 
 
 
481 aa  270  5e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  38.96 
 
 
498 aa  270  5e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  37.69 
 
 
476 aa  270  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  37.97 
 
 
492 aa  270  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  39.74 
 
 
466 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  37.95 
 
 
483 aa  269  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  36.85 
 
 
475 aa  267  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  36.15 
 
 
507 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  38.18 
 
 
505 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  40.76 
 
 
464 aa  266  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  39.58 
 
 
489 aa  266  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  38.73 
 
 
526 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  37.72 
 
 
481 aa  266  7e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  37.5 
 
 
504 aa  266  8e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  37.15 
 
 
489 aa  266  8e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  36.75 
 
 
473 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  38.16 
 
 
500 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  42.75 
 
 
528 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  37.84 
 
 
502 aa  265  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  38.99 
 
 
473 aa  265  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  37.63 
 
 
491 aa  265  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>