More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5561 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  73.12 
 
 
490 aa  683    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  100 
 
 
488 aa  960    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  72.21 
 
 
492 aa  681    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  72.21 
 
 
492 aa  681    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  85.89 
 
 
487 aa  801    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  61.85 
 
 
504 aa  525  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  61.29 
 
 
489 aa  521  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  57.83 
 
 
491 aa  522  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  57.47 
 
 
514 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  59.41 
 
 
483 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  59.41 
 
 
495 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  59.41 
 
 
483 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  58.9 
 
 
494 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  59.41 
 
 
495 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  59.41 
 
 
495 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  59.18 
 
 
495 aa  504  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  59.41 
 
 
483 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  58.68 
 
 
494 aa  502  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  59.41 
 
 
495 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  58.68 
 
 
494 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  58.68 
 
 
493 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  58.52 
 
 
501 aa  495  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  58.68 
 
 
493 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  54.06 
 
 
504 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  57.99 
 
 
494 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  53.57 
 
 
503 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  58.45 
 
 
493 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  56.88 
 
 
504 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  57.17 
 
 
500 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  58.19 
 
 
520 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  51.09 
 
 
503 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  55.93 
 
 
464 aa  462  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0274  protease Do  52.69 
 
 
509 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.408213 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  51.84 
 
 
473 aa  450  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1097  peptidase S1C, Do  51.15 
 
 
479 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.676957  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  50.11 
 
 
473 aa  436  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  53.24 
 
 
489 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  52.04 
 
 
487 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  50.78 
 
 
479 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  50.79 
 
 
474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  51.01 
 
 
477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  51.01 
 
 
477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  46.96 
 
 
492 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  50.77 
 
 
481 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  50.56 
 
 
474 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  47.86 
 
 
502 aa  405  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  47.4 
 
 
479 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  47.18 
 
 
477 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1819  hypothetical protein  46.99 
 
 
518 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1641  peptidase s1, chymotrypsin:pdz/dhr/glgf  47.18 
 
 
518 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.554784  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  48.43 
 
 
502 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  48.43 
 
 
502 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1664  peptidase s1, chymotrypsin:pdz/dhr/glgf  46.8 
 
 
518 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.442424  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  48.43 
 
 
502 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  49.67 
 
 
485 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  48.41 
 
 
498 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  46.38 
 
 
491 aa  398  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  48.32 
 
 
505 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  46.33 
 
 
477 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5776  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  52.13 
 
 
507 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  46.52 
 
 
487 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  47.97 
 
 
507 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  48.34 
 
 
476 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  48.31 
 
 
516 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  49.1 
 
 
474 aa  392  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  49.34 
 
 
461 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  49.34 
 
 
485 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  47.73 
 
 
490 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  49.34 
 
 
502 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  48.11 
 
 
498 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  48.13 
 
 
493 aa  391  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  48.11 
 
 
498 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  48.11 
 
 
498 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  49.34 
 
 
502 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3947  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.59 
 
 
541 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.889809  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4410  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.32 
 
 
584 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  47.63 
 
 
482 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  46.86 
 
 
500 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  48.9 
 
 
490 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  46.88 
 
 
509 aa  386  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  47.94 
 
 
499 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  47.85 
 
 
473 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  45.13 
 
 
493 aa  385  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  46.82 
 
 
503 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  45.33 
 
 
503 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  45.14 
 
 
488 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  47.95 
 
 
473 aa  381  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  44.8 
 
 
505 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-