More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0274 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0274  protease Do  100 
 
 
509 aa  993    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.408213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  55.25 
 
 
491 aa  501  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  53.8 
 
 
501 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  55.58 
 
 
504 aa  481  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  52.72 
 
 
503 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  55.92 
 
 
520 aa  471  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  56.09 
 
 
514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  55.56 
 
 
488 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  52.67 
 
 
503 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  55.23 
 
 
487 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  52.11 
 
 
504 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  53.91 
 
 
495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  53.74 
 
 
492 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  53.74 
 
 
492 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  53.24 
 
 
495 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  53.24 
 
 
495 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  52.58 
 
 
489 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  53.24 
 
 
495 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  53.24 
 
 
483 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  53.24 
 
 
483 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  53.24 
 
 
495 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  53.24 
 
 
483 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  53.38 
 
 
494 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  52.6 
 
 
494 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  52.82 
 
 
494 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  52.65 
 
 
493 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  52.65 
 
 
493 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  52.65 
 
 
494 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  52.43 
 
 
493 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  52.9 
 
 
490 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  52.22 
 
 
500 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  51.69 
 
 
504 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  49.67 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1097  peptidase S1C, Do  48.73 
 
 
479 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.676957  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  45.83 
 
 
473 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  48.58 
 
 
489 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  48.48 
 
 
477 aa  376  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  48.48 
 
 
477 aa  376  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  44.21 
 
 
473 aa  363  3e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  45.98 
 
 
473 aa  358  9e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  44.22 
 
 
477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  43.93 
 
 
492 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  44.03 
 
 
479 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  44 
 
 
477 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  45.37 
 
 
478 aa  352  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  44.91 
 
 
479 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  42.83 
 
 
469 aa  346  7e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  41.63 
 
 
502 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  41.63 
 
 
502 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  47.31 
 
 
487 aa  345  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  43.6 
 
 
474 aa  345  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  41.63 
 
 
502 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  44.74 
 
 
481 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  43.97 
 
 
474 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  42.64 
 
 
461 aa  343  5e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  42.86 
 
 
502 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  42.86 
 
 
502 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  42.86 
 
 
485 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  43.75 
 
 
474 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  42.67 
 
 
484 aa  340  5e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  42.64 
 
 
485 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  42.83 
 
 
471 aa  334  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  42.23 
 
 
490 aa  333  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  44.62 
 
 
477 aa  333  6e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  41.54 
 
 
498 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  41.54 
 
 
498 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  41.54 
 
 
498 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  41.05 
 
 
482 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  43.7 
 
 
481 aa  330  3e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  42.95 
 
 
473 aa  330  4e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  40.86 
 
 
499 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  40.86 
 
 
499 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  40.9 
 
 
500 aa  327  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  41.16 
 
 
467 aa  322  7e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  41.98 
 
 
516 aa  321  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  44.37 
 
 
492 aa  320  5e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  41.36 
 
 
474 aa  319  7.999999999999999e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  40.97 
 
 
491 aa  317  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  41.81 
 
 
503 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  41.18 
 
 
503 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  39.41 
 
 
505 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  39.66 
 
 
502 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  40.8 
 
 
496 aa  314  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  41.94 
 
 
493 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  41.11 
 
 
473 aa  313  5.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  38.99 
 
 
507 aa  312  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  41.69 
 
 
509 aa  310  5e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  40.43 
 
 
498 aa  309  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  42.18 
 
 
514 aa  309  9e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0037  protease Do  42.86 
 
 
489 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  42.06 
 
 
488 aa  307  4.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  40 
 
 
483 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  40.22 
 
 
505 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  42.57 
 
 
498 aa  303  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  44.54 
 
 
511 aa  302  9e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  41.41 
 
 
514 aa  300  3e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  42.32 
 
 
464 aa  299  7e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  41.67 
 
 
476 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  41.67 
 
 
490 aa  297  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  39.22 
 
 
487 aa  293  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>