More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1952 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1952  protease Do  100 
 
 
473 aa  942    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  58.91 
 
 
477 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  57.67 
 
 
481 aa  478  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  52.13 
 
 
473 aa  449  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  52.25 
 
 
474 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  51.91 
 
 
474 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  52.97 
 
 
471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  51.69 
 
 
474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  51.69 
 
 
478 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  51.07 
 
 
479 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  49.38 
 
 
479 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  49.59 
 
 
481 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  51 
 
 
492 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0037  protease Do  51.11 
 
 
489 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  50.54 
 
 
473 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  50.86 
 
 
477 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  47.6 
 
 
469 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  50 
 
 
482 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  50.21 
 
 
477 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  51.46 
 
 
492 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  47.85 
 
 
473 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  47.7 
 
 
464 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  48.2 
 
 
473 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  50 
 
 
477 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  50 
 
 
477 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  44.58 
 
 
484 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  46.67 
 
 
467 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1396  serine protease, DO/DeqQ family  45.27 
 
 
479 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.333333  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1117  protease Do  45.27 
 
 
491 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0590546  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  45.57 
 
 
461 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  47.96 
 
 
487 aa  375  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  46.9 
 
 
495 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  46.86 
 
 
464 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  45.47 
 
 
502 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  45.47 
 
 
502 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  45.47 
 
 
502 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  46.9 
 
 
483 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  46.9 
 
 
483 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  46.9 
 
 
495 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  46.9 
 
 
495 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  45.83 
 
 
485 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  46.93 
 
 
504 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  45.61 
 
 
485 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  46.9 
 
 
495 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  45.83 
 
 
502 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  46.9 
 
 
495 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  45.83 
 
 
502 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  46.9 
 
 
483 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  44.84 
 
 
490 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  45.15 
 
 
505 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  46 
 
 
494 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  47.87 
 
 
488 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  46.59 
 
 
503 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  47.97 
 
 
504 aa  364  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  47.12 
 
 
500 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  46.39 
 
 
501 aa  364  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  45.49 
 
 
487 aa  364  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  46.31 
 
 
494 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  45.92 
 
 
498 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  45.64 
 
 
493 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  45.56 
 
 
494 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  45.64 
 
 
493 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  47.52 
 
 
492 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  47.52 
 
 
492 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  46.68 
 
 
489 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  44.4 
 
 
491 aa  362  6e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  45.41 
 
 
494 aa  362  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  44.95 
 
 
503 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  45.41 
 
 
493 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  46.22 
 
 
509 aa  360  3e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  45.3 
 
 
503 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  46.34 
 
 
490 aa  360  4e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  47.18 
 
 
489 aa  358  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  43.82 
 
 
505 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  44.99 
 
 
514 aa  356  5e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  44.77 
 
 
504 aa  356  5e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  42.89 
 
 
499 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  43.25 
 
 
502 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  42.89 
 
 
499 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  41.89 
 
 
500 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  43.06 
 
 
511 aa  352  1e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  43.79 
 
 
474 aa  352  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  44.56 
 
 
501 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  47.06 
 
 
493 aa  350  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  42.59 
 
 
498 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  42.59 
 
 
498 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  42.59 
 
 
498 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  44.44 
 
 
491 aa  348  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  45.93 
 
 
516 aa  348  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  45.13 
 
 
473 aa  348  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2849  serine protease, DO/DeqQ family  41.58 
 
 
506 aa  347  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.489599  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  46.29 
 
 
498 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2470  protease Do  41.58 
 
 
506 aa  347  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.769337  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  43.69 
 
 
489 aa  348  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  44.52 
 
 
483 aa  347  4e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  42.41 
 
 
507 aa  346  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  46.5 
 
 
476 aa  345  7e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  46.73 
 
 
490 aa  345  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  43.51 
 
 
487 aa  344  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  44.9 
 
 
520 aa  343  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>