More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1773 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  100 
 
 
489 aa  984    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  46.14 
 
 
466 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  46.55 
 
 
476 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  46.92 
 
 
457 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  44.49 
 
 
464 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  44.67 
 
 
500 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  45.07 
 
 
501 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  44.11 
 
 
481 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  47.16 
 
 
458 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  44.54 
 
 
511 aa  363  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  44.33 
 
 
464 aa  361  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  43.51 
 
 
473 aa  362  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  42.74 
 
 
478 aa  362  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  43.33 
 
 
477 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  43.36 
 
 
528 aa  361  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  43.69 
 
 
473 aa  360  4e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  45.77 
 
 
516 aa  359  8e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  43.72 
 
 
508 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  45.23 
 
 
475 aa  357  2.9999999999999997e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  42.58 
 
 
524 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  42.58 
 
 
524 aa  356  6.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  43.65 
 
 
479 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  44.47 
 
 
485 aa  353  4e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  43.51 
 
 
474 aa  352  8e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  43.51 
 
 
474 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  43.46 
 
 
523 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  44.54 
 
 
462 aa  350  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  39.92 
 
 
484 aa  349  5e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  43.6 
 
 
469 aa  349  6e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  41.54 
 
 
520 aa  348  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  44.54 
 
 
511 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  44.74 
 
 
511 aa  348  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0037  protease Do  43.8 
 
 
489 aa  347  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  42.71 
 
 
477 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  42.68 
 
 
492 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  42.74 
 
 
496 aa  345  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  44.61 
 
 
471 aa  345  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  42.98 
 
 
483 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  45.08 
 
 
461 aa  345  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  43.1 
 
 
477 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  43.43 
 
 
476 aa  344  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  42.76 
 
 
483 aa  345  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  45.7 
 
 
498 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  42.36 
 
 
522 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  41.3 
 
 
514 aa  340  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  46.14 
 
 
497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  41.25 
 
 
493 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  41.46 
 
 
501 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  43.56 
 
 
497 aa  337  3.9999999999999995e-91  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  43.39 
 
 
498 aa  336  5.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  41.87 
 
 
479 aa  335  9e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  42.65 
 
 
485 aa  334  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  41.23 
 
 
506 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  41.23 
 
 
493 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  40.76 
 
 
480 aa  333  5e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  40.08 
 
 
467 aa  333  5e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  41.6 
 
 
502 aa  333  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  45.45 
 
 
501 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  41.3 
 
 
481 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  42.57 
 
 
499 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  41.08 
 
 
474 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  41.89 
 
 
471 aa  330  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  41.34 
 
 
482 aa  329  6e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  41.24 
 
 
578 aa  329  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  42.66 
 
 
503 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  40.41 
 
 
499 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  39.87 
 
 
588 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  40.95 
 
 
492 aa  327  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  42.52 
 
 
464 aa  327  3e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  41.61 
 
 
518 aa  327  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  45.34 
 
 
497 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  41.61 
 
 
483 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  42.67 
 
 
476 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  40.97 
 
 
487 aa  326  5e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  43.15 
 
 
472 aa  326  5e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  41.94 
 
 
471 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  41.33 
 
 
476 aa  324  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  42.4 
 
 
477 aa  323  3e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  42.4 
 
 
477 aa  323  3e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  41.4 
 
 
473 aa  322  7e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  39.31 
 
 
473 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  41.04 
 
 
525 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  42.22 
 
 
476 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  44.47 
 
 
498 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  40.54 
 
 
464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  40.13 
 
 
473 aa  320  3e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  41.67 
 
 
473 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  40.61 
 
 
494 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  40.61 
 
 
494 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  40.17 
 
 
459 aa  317  4e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  41.19 
 
 
489 aa  317  5e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  40.52 
 
 
535 aa  316  7e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  40.43 
 
 
485 aa  316  8e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  40.38 
 
 
502 aa  315  9e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  40.38 
 
 
502 aa  315  9e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  40.38 
 
 
502 aa  315  9e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  40.8 
 
 
461 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  40.13 
 
 
493 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  40.13 
 
 
493 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  39.87 
 
 
494 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>