More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0602 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  100 
 
 		 516 aa  1018    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  71.86 
 
 		 509 aa  649    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  66.07 
 
 		 493 aa  627  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  67.99 
 
 		 476 aa  624  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  68.2 
 
 		 490 aa  624  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  61.95 
 
 		 491 aa  610  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  63.84 
 
 		 487 aa  610  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  67.38 
 
 		 498 aa  598  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  63.56 
 
 		 488 aa  598  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  66.38 
 
 		 493 aa  595  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  63.79 
 
 		 496 aa  574  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  57.65 
 
 		 505 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  56.7 
 
 		 503 aa  554  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  57.95 
 
 		 498 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  56.01 
 
 		 503 aa  548  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  58.18 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  58.18 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  58.18 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  58.53 
 
 		 498 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  58.53 
 
 		 498 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  58.53 
 
 		 498 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  58.18 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  60.18 
 
 		 461 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  58.18 
 
 		 485 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  58.18 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  58.75 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  58.75 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  55.71 
 
 		 502 aa  531  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  58.05 
 
 		 500 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  58.96 
 
 		 485 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  54.51 
 
 		 505 aa  529  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  56.97 
 
 		 501 aa  528  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  59.3 
 
 		 490 aa  531  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  57.05 
 
 		 507 aa  528  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  55.77 
 
 		 474 aa  491  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  55.7 
 
 		 483 aa  486  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  50.8 
 
 		 473 aa  467  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  51.61 
 
 		 473 aa  449  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  53.59 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  52.42 
 
 		 477 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  52.42 
 
 		 477 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  49.26 
 
 		 514 aa  423  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  49.7 
 
 		 528 aa  419  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  49.47 
 
 		 514 aa  422  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  52.49 
 
 		 489 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  45.76 
 
 		 492 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  48.2 
 
 		 479 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  48.31 
 
 		 488 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  50.55 
 
 		 511 aa  395  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  48.16 
 
 		 491 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  50.22 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  50 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  47.77 
 
 		 477 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  47.35 
 
 		 477 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  47.52 
 
 		 504 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  48.83 
 
 		 481 aa  393  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  46.08 
 
 		 474 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  47.18 
 
 		 473 aa  391  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  47.63 
 
 		 478 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  45.24 
 
 		 479 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  47.45 
 
 		 489 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  48.49 
 
 		 487 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  45.78 
 
 		 487 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  46.11 
 
 		 481 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  45.4 
 
 		 482 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  47.24 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  46.5 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  44.84 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  47.24 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  45.21 
 
 		 514 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  47.35 
 
 		 490 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  46.34 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  46.34 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  46.34 
 
 		 483 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  46.34 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  46.04 
 
 		 473 aa  372  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  46.34 
 
 		 483 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  46.34 
 
 		 483 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  46.34 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  45.93 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  46.08 
 
 		 494 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  41.9 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  45.9 
 
 		 495 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  46.31 
 
 		 493 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  46.31 
 
 		 493 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  44.62 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  46.56 
 
 		 494 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  46.31 
 
 		 494 aa  365  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  45.93 
 
 		 473 aa  363  3e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  46.08 
 
 		 493 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  45.96 
 
 		 492 aa  363  6e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  45.96 
 
 		 492 aa  363  6e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  44.99 
 
 		 494 aa  360  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  41.27 
 
 		 469 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  45.24 
 
 		 520 aa  355  8.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  43.59 
 
 		 501 aa  355  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  48.61 
 
 		 492 aa  350  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  45.45 
 
 		 500 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1117  protease Do  42.54 
 
 		 491 aa  348  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0590546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1396  serine protease, DO/DeqQ family  42.8 
 
 		 479 aa  346  6e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.333333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>