More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0019 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0019  protease Do  100 
 
 		 466 aa  934    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.822523  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2092  protease Do  50.63 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12778  serine protease precursor  51.28 
 
 		 467 aa  439  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  42.21 
 
 		 508 aa  335  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  41.47 
 
 		 498 aa  329  8e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  42.11 
 
 		 472 aa  318  1e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0618  hypothetical protein  41.78 
 
 		 503 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  39.87 
 
 		 506 aa  312  7.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0052  serine protease  42.25 
 
 		 483 aa  312  9e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  38.66 
 
 		 512 aa  293  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  35.92 
 
 		 535 aa  291  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  39.38 
 
 		 462 aa  271  2e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  35.54 
 
 		 514 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0209  protease Do  38.12 
 
 		 517 aa  268  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0976741 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  37.68 
 
 		 455 aa  263  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  36.86 
 
 		 491 aa  263  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  35.13 
 
 		 514 aa  262  1e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  38.4 
 
 		 456 aa  262  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  39.26 
 
 		 455 aa  261  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  35.19 
 
 		 473 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  38.54 
 
 		 449 aa  259  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  36.43 
 
 		 471 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  33.94 
 
 		 493 aa  258  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  39.51 
 
 		 455 aa  257  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  34.75 
 
 		 455 aa  257  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  34.04 
 
 		 477 aa  257  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  34.04 
 
 		 477 aa  257  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  37.95 
 
 		 450 aa  257  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  36.2 
 
 		 469 aa  256  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  38.19 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  38.19 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  38.19 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  38.19 
 
 		 450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  37.77 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  34.5 
 
 		 455 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  34.5 
 
 		 451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  34.5 
 
 		 455 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  34.5 
 
 		 455 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  34.5 
 
 		 455 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  36.43 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  38.18 
 
 		 450 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  36.43 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  38.18 
 
 		 450 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  38.18 
 
 		 450 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  36.43 
 
 		 463 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  39.59 
 
 		 459 aa  251  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  34.33 
 
 		 488 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  33.78 
 
 		 496 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  35.46 
 
 		 511 aa  251  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  34.04 
 
 		 457 aa  251  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  34.95 
 
 		 487 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  36.87 
 
 		 456 aa  251  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  33.41 
 
 		 502 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  33.41 
 
 		 502 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  33.41 
 
 		 502 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  39.8 
 
 		 472 aa  250  5e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  37.63 
 
 		 456 aa  249  6e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  34.83 
 
 		 458 aa  249  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  32.41 
 
 		 487 aa  249  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  33.69 
 
 		 489 aa  249  6e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  35.59 
 
 		 478 aa  249  7e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  33.71 
 
 		 461 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  37.44 
 
 		 451 aa  249  9e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  35.24 
 
 		 502 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  36.63 
 
 		 456 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  35.24 
 
 		 485 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  35.24 
 
 		 502 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  34.08 
 
 		 488 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0128556 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  34.09 
 
 		 455 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  34.09 
 
 		 455 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  34.09 
 
 		 455 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  33.13 
 
 		 502 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  34.09 
 
 		 455 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  34.09 
 
 		 455 aa  248  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  35.66 
 
 		 484 aa  248  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  34.09 
 
 		 455 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  34.09 
 
 		 455 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  36.83 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  34.09 
 
 		 455 aa  248  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  34.09 
 
 		 455 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0289  protease Do  38.66 
 
 		 456 aa  247  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0319386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  33.26 
 
 		 485 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  35.64 
 
 		 503 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4352  protease Do  38.29 
 
 		 456 aa  246  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208163  decreased coverage  0.00128029 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  33.11 
 
 		 516 aa  246  8e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  37.41 
 
 		 453 aa  246  8e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  41.78 
 
 		 482 aa  245  9e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  35.65 
 
 		 467 aa  245  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  36.5 
 
 		 481 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  33.12 
 
 		 491 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  37.05 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  35.73 
 
 		 473 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  34.18 
 
 		 477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  34.96 
 
 		 475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  36.03 
 
 		 460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  35.91 
 
 		 513 aa  244  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  32.43 
 
 		 476 aa  244  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  32.43 
 
 		 490 aa  244  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  33.2 
 
 		 503 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  34.6 
 
 		 503 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>