More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3006 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  100 
 
 		 472 aa  945    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0052  serine protease  45.31 
 
 		 483 aa  361  2e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  42.86 
 
 		 508 aa  345  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  42.25 
 
 		 506 aa  336  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0618  hypothetical protein  41.05 
 
 		 503 aa  332  8e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  45.27 
 
 		 498 aa  327  3e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12778  serine protease precursor  38.87 
 
 		 467 aa  309  8e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  43.55 
 
 		 512 aa  309  8e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0019  protease Do  41.89 
 
 		 466 aa  309  9e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.822523  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0209  protease Do  39.22 
 
 		 517 aa  300  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0976741 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2092  protease Do  44.85 
 
 		 471 aa  296  4e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  44.75 
 
 		 535 aa  293  5e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  41.48 
 
 		 503 aa  270  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  36.9 
 
 		 504 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  38.53 
 
 		 497 aa  257  2e-67  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  45.05 
 
 		 393 aa  253  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  33.96 
 
 		 491 aa  253  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  39.89 
 
 		 474 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  39.2 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  36.15 
 
 		 490 aa  249  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  35.63 
 
 		 474 aa  250  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  39.68 
 
 		 474 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  36.89 
 
 		 502 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  36.41 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  37.24 
 
 		 506 aa  248  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  36.75 
 
 		 469 aa  246  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  34.27 
 
 		 473 aa  246  9e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  36.74 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  37.67 
 
 		 483 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  36.74 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  38.22 
 
 		 460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  37.4 
 
 		 483 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  34.46 
 
 		 487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  38.12 
 
 		 520 aa  245  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  37.53 
 
 		 492 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  37.53 
 
 		 492 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  36.51 
 
 		 450 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  37.7 
 
 		 504 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  34.27 
 
 		 514 aa  243  7.999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  36.36 
 
 		 499 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  36.09 
 
 		 499 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.44 
 
 		 380 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  33.7 
 
 		 475 aa  242  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  35.37 
 
 		 482 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  35.71 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  35.71 
 
 		 450 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  37.3 
 
 		 502 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  39.14 
 
 		 396 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  35.71 
 
 		 450 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  36.21 
 
 		 472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  39.83 
 
 		 511 aa  240  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  36.64 
 
 		 451 aa  240  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  35.14 
 
 		 505 aa  239  6.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  34.57 
 
 		 488 aa  239  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  34.74 
 
 		 492 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  36.36 
 
 		 500 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  36.78 
 
 		 505 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  36.09 
 
 		 490 aa  239  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  36.46 
 
 		 501 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  36.84 
 
 		 487 aa  239  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  40.06 
 
 		 471 aa  238  1e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  38.12 
 
 		 502 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  35.48 
 
 		 450 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  38.12 
 
 		 502 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  38.48 
 
 		 496 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  38.12 
 
 		 502 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  36.46 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  34.67 
 
 		 477 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  38.12 
 
 		 502 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  36.27 
 
 		 507 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  38.12 
 
 		 502 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  38.12 
 
 		 461 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  38.12 
 
 		 485 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  33.14 
 
 		 514 aa  237  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  35.03 
 
 		 502 aa  237  4e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  34.03 
 
 		 479 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  32.68 
 
 		 477 aa  236  6e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  34.58 
 
 		 473 aa  236  7e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  39.78 
 
 		 476 aa  236  8e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  35.31 
 
 		 514 aa  236  8e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  35.56 
 
 		 472 aa  236  9e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  34.51 
 
 		 477 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  35.58 
 
 		 471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  35.75 
 
 		 498 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  43.92 
 
 		 471 aa  235  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  35.75 
 
 		 498 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  38.31 
 
 		 511 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  35.75 
 
 		 498 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  35.34 
 
 		 472 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  37.97 
 
 		 489 aa  233  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  34.2 
 
 		 491 aa  232  9e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  37.27 
 
 		 528 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.31 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  35.31 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  41.59 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  37.82 
 
 		 481 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  37.23 
 
 		 472 aa  231  3e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  40.28 
 
 		 467 aa  231  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  36.13 
 
 		 489 aa  230  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  38.11 
 
 		 476 aa  230  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.290182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>