More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3616 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  100 
 
 
467 aa  936    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  42.96 
 
 
461 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  38.41 
 
 
478 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  38.32 
 
 
476 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  43.65 
 
 
479 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  37.55 
 
 
503 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  38.12 
 
 
506 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  36.99 
 
 
504 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  37.01 
 
 
502 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  40.37 
 
 
464 aa  302  9e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  37.55 
 
 
464 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  38.16 
 
 
472 aa  299  6e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  39.58 
 
 
457 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  36.84 
 
 
493 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  39.91 
 
 
450 aa  295  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  38.07 
 
 
466 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  38.5 
 
 
505 aa  293  3e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  37.84 
 
 
506 aa  294  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  39.1 
 
 
450 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  36.25 
 
 
474 aa  293  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  38.94 
 
 
450 aa  293  6e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  38.94 
 
 
450 aa  293  6e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  38.72 
 
 
450 aa  293  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  37.61 
 
 
493 aa  292  8e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  42.16 
 
 
450 aa  292  8e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  39.53 
 
 
458 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  43.57 
 
 
451 aa  291  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  35.2 
 
 
485 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  38.7 
 
 
485 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  43.31 
 
 
453 aa  290  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  38.35 
 
 
497 aa  290  4e-77  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  35.67 
 
 
471 aa  290  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  42.56 
 
 
404 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  42.82 
 
 
496 aa  290  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  40.66 
 
 
513 aa  290  5.0000000000000004e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  42.78 
 
 
484 aa  289  8e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  41.94 
 
 
450 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  38.69 
 
 
446 aa  288  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  35.2 
 
 
491 aa  288  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  38.5 
 
 
476 aa  288  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  42.3 
 
 
404 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  42.55 
 
 
474 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  42.55 
 
 
474 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  42.55 
 
 
474 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  42.55 
 
 
474 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  42.55 
 
 
474 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  36.32 
 
 
501 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  42.55 
 
 
474 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  42.55 
 
 
474 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  40.86 
 
 
460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  43.27 
 
 
449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  41.42 
 
 
398 aa  286  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  38.56 
 
 
499 aa  286  5e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  43.28 
 
 
452 aa  286  5e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  42.01 
 
 
450 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  42.55 
 
 
474 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  42.01 
 
 
450 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  42.09 
 
 
450 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  36.12 
 
 
476 aa  286  8e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  37.72 
 
 
474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  37.72 
 
 
474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  37.12 
 
 
498 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  42.53 
 
 
451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  35.98 
 
 
476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  40.63 
 
 
403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  42.82 
 
 
475 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  42.82 
 
 
475 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  42.82 
 
 
478 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  37.05 
 
 
515 aa  284  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  42.82 
 
 
478 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  42.82 
 
 
475 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  41.75 
 
 
450 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  37.13 
 
 
502 aa  283  6.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  39.95 
 
 
472 aa  282  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  42.42 
 
 
387 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  37.86 
 
 
461 aa  281  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00159  hypothetical protein  42.01 
 
 
474 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  37.92 
 
 
485 aa  280  4e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  38.85 
 
 
522 aa  280  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  37.76 
 
 
476 aa  280  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  40.41 
 
 
472 aa  279  6e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  37.64 
 
 
511 aa  279  7e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  38.68 
 
 
471 aa  279  8e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  43.65 
 
 
396 aa  279  8e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  46.27 
 
 
393 aa  279  9e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  38.63 
 
 
455 aa  279  9e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.32 
 
 
398 aa  279  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  38.34 
 
 
456 aa  277  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  39.21 
 
 
456 aa  277  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  39.54 
 
 
459 aa  276  4e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  47.13 
 
 
385 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  37.5 
 
 
402 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  37.64 
 
 
480 aa  276  6e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  42.51 
 
 
401 aa  276  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.51 
 
 
401 aa  276  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.51 
 
 
401 aa  275  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  42.51 
 
 
402 aa  275  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  37.5 
 
 
402 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  35.88 
 
 
465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  38.8 
 
 
455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>