More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1733 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0606  protease Do  73.41 
 
 		 523 aa  727    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  100 
 
 		 522 aa  1034    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  63.04 
 
 		 501 aa  593  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  61.38 
 
 		 511 aa  589  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  59.54 
 
 		 500 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  63.91 
 
 		 516 aa  578  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  60.77 
 
 		 511 aa  571  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  60.57 
 
 		 511 aa  570  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  59.5 
 
 		 501 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  58.14 
 
 		 497 aa  531  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  57.03 
 
 		 498 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  55.42 
 
 		 496 aa  520  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  58.86 
 
 		 497 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  58.61 
 
 		 499 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  58.77 
 
 		 498 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  55.36 
 
 		 498 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  50.4 
 
 		 588 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  51.06 
 
 		 520 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  50.29 
 
 		 578 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  48.6 
 
 		 524 aa  472  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  51.8 
 
 		 528 aa  471  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  48.42 
 
 		 524 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  53.5 
 
 		 471 aa  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  51.69 
 
 		 487 aa  460  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  51.98 
 
 		 508 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  51.51 
 
 		 502 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  48.65 
 
 		 496 aa  434  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  50.4 
 
 		 514 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  50.96 
 
 		 501 aa  420  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  47.16 
 
 		 493 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  47.77 
 
 		 506 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  47.77 
 
 		 493 aa  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  46.56 
 
 		 515 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  48.88 
 
 		 499 aa  391  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  45.55 
 
 		 535 aa  389  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  41.86 
 
 		 524 aa  351  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  43.79 
 
 		 513 aa  350  5e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  43.79 
 
 		 513 aa  350  5e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  43.27 
 
 		 518 aa  347  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  41.12 
 
 		 491 aa  345  8.999999999999999e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  42.63 
 
 		 459 aa  345  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  41.84 
 
 		 529 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  42.43 
 
 		 476 aa  341  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  40.89 
 
 		 527 aa  333  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  42.32 
 
 		 517 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  43.5 
 
 		 457 aa  330  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  39.66 
 
 		 502 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  42.36 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  41.87 
 
 		 520 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  43.58 
 
 		 509 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  41.37 
 
 		 508 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  43.12 
 
 		 501 aa  326  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  42.71 
 
 		 523 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  40.5 
 
 		 483 aa  325  9e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  40.31 
 
 		 483 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  42.42 
 
 		 500 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  40.68 
 
 		 527 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  42.51 
 
 		 491 aa  322  7e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  41.55 
 
 		 501 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  41.51 
 
 		 506 aa  320  5e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  41.42 
 
 		 503 aa  315  9e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  41.42 
 
 		 503 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  40.75 
 
 		 526 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  39.18 
 
 		 497 aa  314  1.9999999999999998e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  41.04 
 
 		 483 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  41.97 
 
 		 464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  41.44 
 
 		 501 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  38.65 
 
 		 504 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  40.28 
 
 		 485 aa  312  7.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  38.89 
 
 		 528 aa  312  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  38.46 
 
 		 520 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  39.87 
 
 		 525 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  43.25 
 
 		 510 aa  312  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  42.86 
 
 		 458 aa  312  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  43.81 
 
 		 496 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  44.62 
 
 		 496 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  38.01 
 
 		 523 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  43.3 
 
 		 496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  41.09 
 
 		 476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  39.35 
 
 		 475 aa  304  3.0000000000000004e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  40.41 
 
 		 461 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  39.84 
 
 		 477 aa  303  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  40.87 
 
 		 476 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  39.67 
 
 		 481 aa  303  7.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  41.43 
 
 		 472 aa  302  9e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  38.08 
 
 		 473 aa  301  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  37.57 
 
 		 527 aa  302  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  39.66 
 
 		 466 aa  302  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  39.29 
 
 		 528 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  36.69 
 
 		 505 aa  301  2e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  39.45 
 
 		 473 aa  300  4e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  42.96 
 
 		 537 aa  300  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  37.52 
 
 		 476 aa  300  5e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  40.04 
 
 		 462 aa  299  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  39.64 
 
 		 477 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  40.17 
 
 		 479 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  44.95 
 
 		 464 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  39.41 
 
 		 492 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  39.27 
 
 		 485 aa  298  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  39.74 
 
 		 485 aa  297  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>