More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1207 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1207  serine protease  100 
 
 
474 aa  942    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  100 
 
 
474 aa  942    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  82.98 
 
 
476 aa  788    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  58.73 
 
 
464 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  58.21 
 
 
492 aa  511  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  55.85 
 
 
467 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  56.01 
 
 
467 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1014  protease Do  56.07 
 
 
465 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370386  normal  0.451123 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  54.53 
 
 
467 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  51.45 
 
 
496 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  52.64 
 
 
464 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  50.9 
 
 
463 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  52.87 
 
 
468 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  53.19 
 
 
485 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  50.78 
 
 
463 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  50.11 
 
 
464 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  53.42 
 
 
496 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  50.78 
 
 
467 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  50.44 
 
 
488 aa  425  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  50.44 
 
 
488 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  48.9 
 
 
494 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  48.69 
 
 
476 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  51.03 
 
 
471 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  50.11 
 
 
471 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  50.11 
 
 
485 aa  408  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  48.3 
 
 
504 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2041  protease Do  46.48 
 
 
480 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  46.32 
 
 
461 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  46.74 
 
 
491 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  46.54 
 
 
461 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  46.19 
 
 
461 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0287  peptidase S1C, Do  46.95 
 
 
465 aa  342  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1649  protease Do  45.65 
 
 
474 aa  332  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  43.9 
 
 
465 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  43.22 
 
 
457 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  42.04 
 
 
455 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  38.9 
 
 
472 aa  305  9.000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  41.74 
 
 
455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.23 
 
 
513 aa  304  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  43.25 
 
 
464 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  44.1 
 
 
458 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  41.94 
 
 
466 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.69 
 
 
412 aa  300  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  43.36 
 
 
464 aa  296  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  45.63 
 
 
469 aa  296  6e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  39.11 
 
 
461 aa  293  4e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.21 
 
 
396 aa  293  6e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  47.61 
 
 
398 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  48.8 
 
 
392 aa  291  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  42.46 
 
 
478 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.57 
 
 
476 aa  290  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  46.78 
 
 
403 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  38.81 
 
 
476 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  48.2 
 
 
385 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  47.49 
 
 
404 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  48 
 
 
396 aa  287  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  42.93 
 
 
450 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.19 
 
 
398 aa  286  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  45.35 
 
 
407 aa  286  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  46.93 
 
 
404 aa  285  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  46.81 
 
 
380 aa  285  9e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  40.27 
 
 
456 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  37.72 
 
 
467 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  39.87 
 
 
535 aa  285  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  38.72 
 
 
491 aa  284  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.65 
 
 
417 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  39.29 
 
 
476 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  43.7 
 
 
460 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  40.17 
 
 
458 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  36.21 
 
 
472 aa  280  3e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  39.74 
 
 
450 aa  280  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  41.03 
 
 
506 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  41.03 
 
 
493 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.87 
 
 
379 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  38.13 
 
 
485 aa  280  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  38.48 
 
 
473 aa  280  4e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  38.57 
 
 
476 aa  280  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  42.08 
 
 
500 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  41.96 
 
 
473 aa  280  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  44.99 
 
 
407 aa  279  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  45.56 
 
 
403 aa  279  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.67 
 
 
385 aa  279  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  46.46 
 
 
383 aa  279  8e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  41.1 
 
 
475 aa  279  8e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  43.73 
 
 
497 aa  279  9e-74  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  40.13 
 
 
451 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  43.99 
 
 
386 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  38.68 
 
 
473 aa  278  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  45.51 
 
 
383 aa  278  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  38.69 
 
 
502 aa  278  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  38.25 
 
 
474 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  40.71 
 
 
493 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  36.93 
 
 
502 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  38.15 
 
 
459 aa  277  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  45.51 
 
 
401 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  39.2 
 
 
451 aa  277  3e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  37.66 
 
 
506 aa  277  3e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  38.72 
 
 
455 aa  277  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.51 
 
 
401 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.33 
 
 
380 aa  276  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>