More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0943 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0943  protease Do  100 
 
 		 491 aa  970    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  47.95 
 
 		 520 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  50.22 
 
 		 513 aa  421  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  50.22 
 
 		 513 aa  421  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  50.22 
 
 		 523 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  49.89 
 
 		 527 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  49.89 
 
 		 516 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  46.38 
 
 		 517 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  48.8 
 
 		 528 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  47.89 
 
 		 523 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  44.42 
 
 		 529 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  45.56 
 
 		 524 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  43.81 
 
 		 527 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  47.4 
 
 		 520 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  43.38 
 
 		 527 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  45.42 
 
 		 491 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  47.68 
 
 		 528 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  47.45 
 
 		 526 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  48.68 
 
 		 509 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  43.03 
 
 		 505 aa  385  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  46.61 
 
 		 502 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  46.56 
 
 		 498 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  47.33 
 
 		 500 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  46.76 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  47.49 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  47.49 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  45.26 
 
 		 508 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  47.57 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  47.67 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  45.49 
 
 		 515 aa  375  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  46.44 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  46.9 
 
 		 501 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  48.67 
 
 		 503 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  48.67 
 
 		 503 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  47.84 
 
 		 535 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  46.23 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  45.7 
 
 		 508 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  47.62 
 
 		 525 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  46.2 
 
 		 518 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  44.67 
 
 		 506 aa  366  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  46.49 
 
 		 500 aa  365  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  45.88 
 
 		 487 aa  364  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  45.86 
 
 		 501 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  43.94 
 
 		 528 aa  362  7.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  47.02 
 
 		 496 aa  361  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  46.8 
 
 		 496 aa  360  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  44.79 
 
 		 511 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  44.71 
 
 		 476 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  43.53 
 
 		 523 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  47.08 
 
 		 483 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  41.3 
 
 		 588 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  41.05 
 
 		 578 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  45.59 
 
 		 511 aa  353  5e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  42.51 
 
 		 520 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  45.38 
 
 		 511 aa  352  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  45.02 
 
 		 516 aa  350  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  44 
 
 		 498 aa  350  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  44.1 
 
 		 483 aa  348  9e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  43.89 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  45.59 
 
 		 501 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  41.67 
 
 		 524 aa  347  3e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  43.42 
 
 		 471 aa  346  4e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  45.63 
 
 		 537 aa  347  4e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  44.86 
 
 		 474 aa  345  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  42.83 
 
 		 499 aa  345  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  43.06 
 
 		 514 aa  344  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  41.46 
 
 		 524 aa  343  4e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  43.17 
 
 		 475 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  44.65 
 
 		 499 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  45.36 
 
 		 498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  45 
 
 		 497 aa  340  4e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  44.81 
 
 		 501 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  40.72 
 
 		 522 aa  338  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  42.89 
 
 		 502 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  38.1 
 
 		 497 aa  337  3.9999999999999995e-91  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  44.86 
 
 		 476 aa  336  5e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  44.28 
 
 		 497 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  43.24 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  43.18 
 
 		 457 aa  333  6e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  43.56 
 
 		 479 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  43.11 
 
 		 464 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  41.3 
 
 		 481 aa  330  4e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  44.07 
 
 		 477 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  43.97 
 
 		 492 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  40.43 
 
 		 482 aa  329  8e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  42.86 
 
 		 474 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  43.11 
 
 		 458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  43.85 
 
 		 477 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  42.42 
 
 		 474 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  41.68 
 
 		 524 aa  325  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  42.76 
 
 		 464 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  41.51 
 
 		 482 aa  323  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  43.23 
 
 		 473 aa  321  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  43.07 
 
 		 473 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  45.69 
 
 		 485 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  45.17 
 
 		 462 aa  319  6e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  44.02 
 
 		 475 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  45.31 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  41.88 
 
 		 479 aa  316  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  41.11 
 
 		 481 aa  316  6e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>