More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0080 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3457  protease Do  67.58 
 
 		 476 aa  653    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  100 
 
 		 471 aa  943    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  77.54 
 
 		 472 aa  752    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  67.37 
 
 		 476 aa  650    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  67.58 
 
 		 476 aa  653    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  60.54 
 
 		 474 aa  557  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  60.53 
 
 		 388 aa  462  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  52.24 
 
 		 478 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  48.64 
 
 		 476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  50.58 
 
 		 457 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  48.65 
 
 		 464 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  51.28 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  46.86 
 
 		 466 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  47.43 
 
 		 464 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  44.42 
 
 		 475 aa  359  5e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  47.25 
 
 		 462 aa  354  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  44.9 
 
 		 502 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  45.03 
 
 		 476 aa  352  7e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  45.66 
 
 		 473 aa  350  4e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  44.54 
 
 		 479 aa  347  3e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  43.34 
 
 		 475 aa  346  6e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  44.98 
 
 		 482 aa  345  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  42.76 
 
 		 504 aa  344  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  42.8 
 
 		 502 aa  342  5.999999999999999e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  44.7 
 
 		 481 aa  339  8e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  44.09 
 
 		 485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  43.89 
 
 		 505 aa  333  3e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  43.65 
 
 		 480 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  42.77 
 
 		 461 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  43.56 
 
 		 485 aa  330  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  41.87 
 
 		 506 aa  330  4e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  43.2 
 
 		 497 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  44.42 
 
 		 464 aa  323  5e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  43.05 
 
 		 499 aa  322  8e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  41.08 
 
 		 498 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  39.88 
 
 		 484 aa  320  3e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  40.78 
 
 		 473 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  47.5 
 
 		 472 aa  319  7e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  42.86 
 
 		 501 aa  318  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  44.19 
 
 		 460 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  41.72 
 
 		 489 aa  316  7e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  42.44 
 
 		 491 aa  315  9e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  42.38 
 
 		 474 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  42.45 
 
 		 500 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  42.38 
 
 		 474 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  43.22 
 
 		 465 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  41.02 
 
 		 498 aa  312  6.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  41.43 
 
 		 467 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  42.7 
 
 		 477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  42.19 
 
 		 473 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  40.35 
 
 		 469 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  41.39 
 
 		 479 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  42.47 
 
 		 492 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  41.24 
 
 		 501 aa  305  9.000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  43.22 
 
 		 473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  41.45 
 
 		 490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  41.57 
 
 		 477 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  38.68 
 
 		 477 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  40.6 
 
 		 499 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  40.57 
 
 		 478 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  39.96 
 
 		 499 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  41.11 
 
 		 481 aa  302  7.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  41.67 
 
 		 482 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  41.11 
 
 		 451 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  52.27 
 
 		 382 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  39.2 
 
 		 525 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  41.44 
 
 		 457 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  40.58 
 
 		 487 aa  301  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  41.44 
 
 		 457 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  41.11 
 
 		 455 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  41.11 
 
 		 455 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  41.11 
 
 		 455 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  40.82 
 
 		 513 aa  300  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  41.32 
 
 		 498 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  41.11 
 
 		 455 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  41.44 
 
 		 463 aa  300  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  41.59 
 
 		 503 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  40.4 
 
 		 505 aa  300  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  40.34 
 
 		 500 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  41.15 
 
 		 503 aa  299  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  40.52 
 
 		 498 aa  299  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  40.52 
 
 		 498 aa  299  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  40.52 
 
 		 498 aa  299  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  41.28 
 
 		 474 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  41.7 
 
 		 506 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  39.82 
 
 		 485 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  40.34 
 
 		 524 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.32 
 
 		 412 aa  297  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  43.42 
 
 		 453 aa  297  4e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  40.54 
 
 		 500 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  39.77 
 
 		 452 aa  296  5e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  41.48 
 
 		 493 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  39.61 
 
 		 502 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  39.61 
 
 		 502 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  39.61 
 
 		 502 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  39.61 
 
 		 502 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  39.61 
 
 		 502 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  41.56 
 
 		 515 aa  296  8e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  40.66 
 
 		 514 aa  295  8e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  39.61 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>