More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3083 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  100 
 
 
462 aa  921    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  56.38 
 
 
457 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  54 
 
 
464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  55.41 
 
 
458 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  52.7 
 
 
466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  54.49 
 
 
464 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  49.06 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  50.23 
 
 
461 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  49.32 
 
 
476 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  49.89 
 
 
475 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  49.89 
 
 
482 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  49.89 
 
 
481 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  50.33 
 
 
472 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  47.48 
 
 
473 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  45.63 
 
 
476 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  47.13 
 
 
478 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  48.39 
 
 
476 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  44.82 
 
 
480 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  47.71 
 
 
485 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  48.17 
 
 
476 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  47.94 
 
 
471 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  45.59 
 
 
485 aa  371  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  45.69 
 
 
473 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  44.75 
 
 
489 aa  362  8e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  45.55 
 
 
492 aa  362  9e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  44.28 
 
 
473 aa  360  3e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  47.25 
 
 
472 aa  358  8e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  46.12 
 
 
474 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  42.77 
 
 
484 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  43.24 
 
 
479 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  46.4 
 
 
481 aa  351  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  43.58 
 
 
473 aa  350  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  42.92 
 
 
483 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  43.07 
 
 
483 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  43.28 
 
 
483 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  40.3 
 
 
469 aa  348  9e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  44.31 
 
 
477 aa  347  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  44.31 
 
 
477 aa  347  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  42.86 
 
 
464 aa  347  3e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  42.98 
 
 
478 aa  346  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  42.59 
 
 
492 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  42.13 
 
 
475 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  42.38 
 
 
477 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  41.96 
 
 
477 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  43.76 
 
 
477 aa  341  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  44.52 
 
 
501 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  41.57 
 
 
502 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  43.2 
 
 
524 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  43.45 
 
 
525 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  42.89 
 
 
485 aa  331  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  45.17 
 
 
535 aa  331  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  42.8 
 
 
502 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  41.46 
 
 
499 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  42.8 
 
 
502 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  41.54 
 
 
474 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  42.8 
 
 
502 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  43.48 
 
 
500 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  41.53 
 
 
503 aa  330  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  45.17 
 
 
491 aa  330  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  41.77 
 
 
482 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  42.67 
 
 
502 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  41.34 
 
 
474 aa  328  9e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  42.67 
 
 
502 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  43.33 
 
 
494 aa  328  9e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  41.53 
 
 
503 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  41.61 
 
 
498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  42.67 
 
 
485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  41.61 
 
 
498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  44 
 
 
479 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  43.12 
 
 
487 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  42.64 
 
 
474 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  41.61 
 
 
498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  41.26 
 
 
499 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  42.74 
 
 
490 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  41.09 
 
 
479 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  42.67 
 
 
461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  45.2 
 
 
516 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  42 
 
 
471 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  42.92 
 
 
493 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  40.91 
 
 
500 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  43.11 
 
 
494 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  42.67 
 
 
474 aa  326  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  43.2 
 
 
523 aa  326  6e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  41.67 
 
 
473 aa  326  6e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  42.69 
 
 
506 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  43.58 
 
 
523 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  42.92 
 
 
483 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  42.92 
 
 
483 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  42.92 
 
 
483 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  42.92 
 
 
495 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  42.92 
 
 
495 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  42.92 
 
 
495 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  42.92 
 
 
495 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  43.27 
 
 
495 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  42.61 
 
 
459 aa  324  2e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  42.22 
 
 
493 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  42.22 
 
 
493 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  41.72 
 
 
487 aa  323  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  40.79 
 
 
500 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  44.67 
 
 
492 aa  323  5e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>