More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0879 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0080  protease degQ  67.37 
 
 		 471 aa  650    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  100 
 
 		 476 aa  949    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  69.41 
 
 		 476 aa  676    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  68.78 
 
 		 476 aa  673    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  66.67 
 
 		 472 aa  641    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  63.31 
 
 		 474 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  60.64 
 
 		 388 aa  462  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  49.48 
 
 		 478 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  51.36 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  51.95 
 
 		 458 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  48.89 
 
 		 464 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  48.86 
 
 		 462 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  45.32 
 
 		 476 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  46.37 
 
 		 466 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  46.64 
 
 		 464 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  43.16 
 
 		 475 aa  345  7e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  44.49 
 
 		 482 aa  338  9e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  45.52 
 
 		 481 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  43.12 
 
 		 485 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  42.64 
 
 		 502 aa  334  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  41.37 
 
 		 476 aa  334  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  41.52 
 
 		 502 aa  332  9e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  43.36 
 
 		 479 aa  330  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  43.51 
 
 		 461 aa  330  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  41.04 
 
 		 504 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  41.8 
 
 		 475 aa  326  7e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  42.95 
 
 		 477 aa  325  8.000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  43.97 
 
 		 473 aa  325  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  41.89 
 
 		 497 aa  323  3e-87  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  42.53 
 
 		 505 aa  323  4e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  43.86 
 
 		 484 aa  322  9.000000000000001e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  40.73 
 
 		 506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  42.37 
 
 		 485 aa  320  5e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  42.44 
 
 		 489 aa  318  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  44.49 
 
 		 464 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  42.99 
 
 		 474 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  42.99 
 
 		 474 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  44.83 
 
 		 458 aa  311  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  42.79 
 
 		 469 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  43.11 
 
 		 473 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  41.72 
 
 		 500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  39.22 
 
 		 473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  38.32 
 
 		 467 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  41.2 
 
 		 523 aa  307  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  40.76 
 
 		 491 aa  306  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  41.31 
 
 		 473 aa  306  5.0000000000000004e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572701  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  44.47 
 
 		 482 aa  306  7e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  39.15 
 
 		 498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  42.98 
 
 		 479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  41.25 
 
 		 524 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  41.69 
 
 		 481 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  41.3 
 
 		 465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  40.09 
 
 		 500 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  39.87 
 
 		 513 aa  304  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  42.73 
 
 		 477 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  41.76 
 
 		 514 aa  304  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  40.97 
 
 		 501 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  52.24 
 
 		 382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  41 
 
 		 501 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  40.13 
 
 		 478 aa  303  6.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  42.06 
 
 		 473 aa  303  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  41.93 
 
 		 492 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  38.18 
 
 		 498 aa  300  3e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  40.74 
 
 		 453 aa  300  4e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  41.72 
 
 		 483 aa  300  5e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  41.7 
 
 		 477 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  43.55 
 
 		 472 aa  299  8e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  39.49 
 
 		 499 aa  299  8e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  41.51 
 
 		 483 aa  299  8e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  40.66 
 
 		 502 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  40.66 
 
 		 502 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  40.66 
 
 		 502 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  40.66 
 
 		 502 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  40.66 
 
 		 502 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  42.43 
 
 		 450 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  42.43 
 
 		 450 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  42.43 
 
 		 450 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  40.17 
 
 		 479 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  40.66 
 
 		 485 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  41.76 
 
 		 471 aa  297  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  40.66 
 
 		 485 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  39.91 
 
 		 487 aa  298  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  40.66 
 
 		 461 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  39.64 
 
 		 480 aa  297  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  40.48 
 
 		 490 aa  297  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  38.97 
 
 		 516 aa  296  4e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  42.36 
 
 		 450 aa  296  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  38.98 
 
 		 493 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  40 
 
 		 513 aa  296  5e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  40 
 
 		 513 aa  296  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  42.73 
 
 		 467 aa  296  5e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  38.79 
 
 		 499 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  38.98 
 
 		 493 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  40.82 
 
 		 523 aa  296  8e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  41.83 
 
 		 474 aa  295  8e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  38.98 
 
 		 506 aa  296  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  42.07 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  39.58 
 
 		 525 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  41.39 
 
 		 485 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  42.47 
 
 		 451 aa  295  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>