More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1160 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  100 
 
 		 498 aa  981    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1164  protease Do  43.17 
 
 		 464 aa  340  4e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0251777  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  42.64 
 
 		 473 aa  331  1e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572701  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  43.15 
 
 		 476 aa  323  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  43.53 
 
 		 464 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  41.02 
 
 		 471 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  37.92 
 
 		 476 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  37.72 
 
 		 476 aa  302  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  38.18 
 
 		 476 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  43.72 
 
 		 475 aa  295  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  37.22 
 
 		 472 aa  292  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  40.37 
 
 		 479 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  37.45 
 
 		 506 aa  281  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  39.46 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  40.44 
 
 		 461 aa  280  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  38.9 
 
 		 485 aa  279  8e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  40.4 
 
 		 504 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  37.8 
 
 		 466 aa  277  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  38.95 
 
 		 478 aa  276  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  37.7 
 
 		 505 aa  276  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  42.21 
 
 		 464 aa  274  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  39.61 
 
 		 502 aa  274  3e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  37.22 
 
 		 482 aa  273  6e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  41.11 
 
 		 485 aa  272  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  37.47 
 
 		 487 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  38.03 
 
 		 499 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  36.04 
 
 		 474 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  39.15 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  38.34 
 
 		 473 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  38.16 
 
 		 498 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  38.16 
 
 		 498 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  38.19 
 
 		 503 aa  270  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  38.16 
 
 		 498 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  37.45 
 
 		 503 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  38.46 
 
 		 473 aa  269  8.999999999999999e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  37.82 
 
 		 499 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  37.58 
 
 		 501 aa  269  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  37.53 
 
 		 500 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  37.44 
 
 		 483 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  38.16 
 
 		 500 aa  266  5e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  37.22 
 
 		 483 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  38.52 
 
 		 471 aa  264  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  37.82 
 
 		 524 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  38.65 
 
 		 502 aa  263  6e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  37.92 
 
 		 490 aa  263  8e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  41.52 
 
 		 462 aa  262  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  36.6 
 
 		 500 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  37.92 
 
 		 492 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  37.92 
 
 		 492 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  36.55 
 
 		 483 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  41.22 
 
 		 511 aa  260  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  36.6 
 
 		 501 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  34.7 
 
 		 502 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  34.7 
 
 		 502 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  34.7 
 
 		 502 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  35.21 
 
 		 476 aa  258  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  37.87 
 
 		 525 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  38.43 
 
 		 453 aa  258  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  38.38 
 
 		 496 aa  257  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  36.54 
 
 		 485 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  37.23 
 
 		 485 aa  257  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  36.54 
 
 		 502 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  36.54 
 
 		 502 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  35.97 
 
 		 461 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  40.1 
 
 		 497 aa  256  8e-67  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  37.61 
 
 		 480 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  39.7 
 
 		 503 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  40.2 
 
 		 504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  38.92 
 
 		 498 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  37.16 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  39.07 
 
 		 474 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  37.32 
 
 		 489 aa  254  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  39.29 
 
 		 474 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  39.81 
 
 		 487 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  39.46 
 
 		 494 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  41.87 
 
 		 493 aa  253  8.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  38.19 
 
 		 505 aa  252  9.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  38.98 
 
 		 473 aa  252  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  37.82 
 
 		 523 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  37.27 
 
 		 524 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  36.84 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  36.36 
 
 		 509 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  37.93 
 
 		 498 aa  251  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  35.12 
 
 		 501 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  37.15 
 
 		 490 aa  250  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  38.5 
 
 		 483 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  38.5 
 
 		 495 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  38.5 
 
 		 483 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  38.5 
 
 		 483 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  39.08 
 
 		 488 aa  250  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  38.5 
 
 		 495 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  39.23 
 
 		 494 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  38.5 
 
 		 495 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  38.5 
 
 		 495 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  38.91 
 
 		 474 aa  249  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  35.03 
 
 		 477 aa  249  7e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  37.83 
 
 		 494 aa  249  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  38.18 
 
 		 491 aa  249  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  36.67 
 
 		 450 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  37.41 
 
 		 508 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>