More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0031 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  100 
 
 
453 aa  899    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  52.62 
 
 
452 aa  456  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  51.29 
 
 
459 aa  436  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  51.42 
 
 
453 aa  432  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  51.08 
 
 
459 aa  434  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  40.43 
 
 
457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  41.42 
 
 
464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  39.87 
 
 
476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  40.34 
 
 
458 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  39.46 
 
 
466 aa  297  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  39.49 
 
 
478 aa  295  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  39.82 
 
 
461 aa  293  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  42.96 
 
 
476 aa  292  9e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  40.84 
 
 
472 aa  286  7e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  41.2 
 
 
476 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  42.02 
 
 
476 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  39.5 
 
 
485 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  36.23 
 
 
474 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  36.23 
 
 
474 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  40.9 
 
 
503 aa  278  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  38.69 
 
 
471 aa  277  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  38.32 
 
 
469 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  36.53 
 
 
473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  39.57 
 
 
455 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  38.32 
 
 
475 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  37.44 
 
 
464 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  34.54 
 
 
501 aa  273  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  38.41 
 
 
485 aa  272  7e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  36.96 
 
 
503 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  35.82 
 
 
464 aa  272  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  42.18 
 
 
456 aa  272  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  39.73 
 
 
455 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  35.44 
 
 
498 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  38.89 
 
 
473 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  36.21 
 
 
503 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  40.24 
 
 
474 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  35.24 
 
 
502 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  38.64 
 
 
500 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  35.44 
 
 
505 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  35.22 
 
 
484 aa  266  5.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  39.44 
 
 
462 aa  266  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  39.9 
 
 
476 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  36.98 
 
 
474 aa  265  8.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  36.17 
 
 
481 aa  264  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  38.53 
 
 
455 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  37.15 
 
 
451 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  38.53 
 
 
455 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  38.53 
 
 
455 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  38.53 
 
 
455 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  35.62 
 
 
479 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  35.32 
 
 
509 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  34.39 
 
 
487 aa  263  4.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  34.12 
 
 
499 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  34.86 
 
 
502 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  34.86 
 
 
502 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  46.45 
 
 
389 aa  261  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  34.86 
 
 
502 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  34.86 
 
 
502 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  34.86 
 
 
485 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  36.3 
 
 
482 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  32.99 
 
 
500 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  34.86 
 
 
502 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  33.91 
 
 
499 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  34.86 
 
 
461 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  34.64 
 
 
485 aa  260  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.9 
 
 
384 aa  260  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  40.38 
 
 
525 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  34.39 
 
 
507 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  36.69 
 
 
501 aa  259  8e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  34.27 
 
 
490 aa  259  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  39.75 
 
 
474 aa  259  9e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  39.75 
 
 
474 aa  259  9e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  38.43 
 
 
498 aa  258  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  35.76 
 
 
496 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  37.73 
 
 
465 aa  258  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  37.25 
 
 
524 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  33.54 
 
 
477 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  39.41 
 
 
473 aa  258  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  34.85 
 
 
474 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  34.61 
 
 
477 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  39.04 
 
 
476 aa  257  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  33.62 
 
 
505 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  36.03 
 
 
514 aa  256  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  36.2 
 
 
493 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  34.67 
 
 
492 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  34.57 
 
 
482 aa  256  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  35.87 
 
 
481 aa  256  6e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  39.62 
 
 
446 aa  256  6e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  37.39 
 
 
516 aa  256  8e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  34.37 
 
 
477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  36.63 
 
 
506 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  39.36 
 
 
480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  35.16 
 
 
467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  38.72 
 
 
460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  39.25 
 
 
483 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  35.61 
 
 
462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  36.71 
 
 
493 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  38.22 
 
 
535 aa  254  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  36.44 
 
 
515 aa  253  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  37.69 
 
 
489 aa  253  4.0000000000000004e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>