More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3170 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  100 
 
 
515 aa  1008    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  65.13 
 
 
501 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  63.47 
 
 
506 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  63.25 
 
 
493 aa  549  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  62.26 
 
 
493 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  56.92 
 
 
499 aa  522  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  58.84 
 
 
514 aa  501  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  49.38 
 
 
487 aa  413  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  47.83 
 
 
500 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  47.13 
 
 
588 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  48.2 
 
 
501 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  44.51 
 
 
524 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  46.29 
 
 
578 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  47.03 
 
 
498 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  44.51 
 
 
524 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  46.99 
 
 
511 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  49.46 
 
 
516 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  44.27 
 
 
520 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  47.21 
 
 
528 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  45.84 
 
 
522 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  47.66 
 
 
501 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  47.1 
 
 
511 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  46.1 
 
 
497 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  47.1 
 
 
511 aa  385  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  46.17 
 
 
496 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  44.58 
 
 
508 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  46.43 
 
 
499 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  48.34 
 
 
471 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  44.06 
 
 
491 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  50.23 
 
 
498 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  47.83 
 
 
497 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  48.65 
 
 
502 aa  375  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  47.64 
 
 
498 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  43 
 
 
523 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  42.49 
 
 
496 aa  350  2e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  45.09 
 
 
506 aa  336  5e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  41.26 
 
 
473 aa  334  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  40.45 
 
 
523 aa  333  6e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  41.31 
 
 
535 aa  332  7.000000000000001e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  41.46 
 
 
500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  41.49 
 
 
473 aa  326  5e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  44.55 
 
 
509 aa  325  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  40.46 
 
 
518 aa  323  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  42.89 
 
 
473 aa  323  4e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  39.07 
 
 
523 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  40.95 
 
 
513 aa  323  6e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  42.99 
 
 
476 aa  323  6e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  40.95 
 
 
513 aa  323  6e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  43.67 
 
 
459 aa  323  7e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  40.21 
 
 
476 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  42.24 
 
 
520 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  39.07 
 
 
529 aa  320  3.9999999999999996e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  39.08 
 
 
457 aa  319  6e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  40.88 
 
 
501 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  40.42 
 
 
505 aa  317  4e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  40.7 
 
 
477 aa  316  6e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  40.7 
 
 
477 aa  316  6e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  40 
 
 
528 aa  316  8e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  40.2 
 
 
476 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  38.45 
 
 
526 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  40.82 
 
 
483 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  41.27 
 
 
528 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  41.89 
 
 
502 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  39.57 
 
 
527 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  41.87 
 
 
516 aa  313  5.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  40 
 
 
524 aa  312  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  40.82 
 
 
483 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  40.82 
 
 
483 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  40.2 
 
 
476 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  42.27 
 
 
481 aa  310  4e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  40.25 
 
 
482 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  39.71 
 
 
474 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  39.38 
 
 
469 aa  307  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  39.75 
 
 
520 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  41.92 
 
 
464 aa  307  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  38.14 
 
 
517 aa  307  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  39.51 
 
 
474 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0037  protease Do  41.08 
 
 
489 aa  306  6e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  42 
 
 
471 aa  306  6e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  38.27 
 
 
464 aa  306  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  39.23 
 
 
504 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  41.01 
 
 
481 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  40.96 
 
 
501 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  39.33 
 
 
458 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  36.02 
 
 
466 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  38.05 
 
 
464 aa  302  9e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  41.37 
 
 
474 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  39.07 
 
 
508 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  38.17 
 
 
527 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  37.78 
 
 
475 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  41.1 
 
 
492 aa  301  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  38.4 
 
 
489 aa  301  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  40.72 
 
 
479 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  39.88 
 
 
503 aa  300  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  39.88 
 
 
503 aa  300  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  38.18 
 
 
527 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  39.96 
 
 
480 aa  300  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  40.41 
 
 
501 aa  300  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  37.45 
 
 
485 aa  300  6e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  39.79 
 
 
477 aa  299  9e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>