More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2014 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2014  protease Do  100 
 
 		 502 aa  995    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  60.31 
 
 		 578 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  61 
 
 		 588 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  60.94 
 
 		 528 aa  563  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  57.14 
 
 		 524 aa  553  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  56.95 
 
 		 524 aa  550  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  56.89 
 
 		 520 aa  546  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  58.65 
 
 		 471 aa  521  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  50.3 
 
 		 496 aa  489  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  55.18 
 
 		 501 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  53.6 
 
 		 511 aa  485  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  51.88 
 
 		 496 aa  484  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  53.81 
 
 		 497 aa  482  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  52.22 
 
 		 500 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  53.21 
 
 		 501 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  54.76 
 
 		 497 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  55.56 
 
 		 498 aa  478  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  51.26 
 
 		 522 aa  476  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  52.41 
 
 		 498 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  55.06 
 
 		 498 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  54.31 
 
 		 499 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  53 
 
 		 511 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  50.79 
 
 		 523 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  54.79 
 
 		 516 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  53 
 
 		 511 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  48.8 
 
 		 508 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  48.69 
 
 		 487 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  49.13 
 
 		 506 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  48.92 
 
 		 493 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  49.57 
 
 		 515 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  48.61 
 
 		 501 aa  403  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  47.16 
 
 		 493 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  47.68 
 
 		 514 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  47.31 
 
 		 499 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  43.59 
 
 		 491 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  44.28 
 
 		 535 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  46.49 
 
 		 459 aa  352  5.9999999999999994e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  41.85 
 
 		 489 aa  339  5e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  39.92 
 
 		 517 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  42.89 
 
 		 476 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  40.49 
 
 		 457 aa  335  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  39.64 
 
 		 513 aa  332  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  39.64 
 
 		 513 aa  332  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  39.37 
 
 		 520 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  39.88 
 
 		 527 aa  329  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  38.74 
 
 		 497 aa  328  1.0000000000000001e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  40.56 
 
 		 518 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  41.13 
 
 		 520 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  40.49 
 
 		 527 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  38.45 
 
 		 529 aa  327  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  38.91 
 
 		 464 aa  326  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  40.89 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  40.93 
 
 		 500 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  41.32 
 
 		 501 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  39.92 
 
 		 506 aa  322  9.000000000000001e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  39.96 
 
 		 524 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  41.51 
 
 		 466 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  42.58 
 
 		 464 aa  317  5e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  40.17 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  41.59 
 
 		 508 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  41.38 
 
 		 483 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  38.69 
 
 		 482 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  39.92 
 
 		 527 aa  313  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  41.16 
 
 		 483 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  39.1 
 
 		 502 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  40.5 
 
 		 477 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  39.8 
 
 		 528 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  39.56 
 
 		 526 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  38.64 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  41.77 
 
 		 483 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  39.59 
 
 		 491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  39.88 
 
 		 523 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  38.8 
 
 		 501 aa  307  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  38 
 
 		 481 aa  307  3e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  40.08 
 
 		 477 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  39.88 
 
 		 492 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  39.72 
 
 		 523 aa  306  8.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  39.79 
 
 		 479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  42.46 
 
 		 509 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  38.57 
 
 		 475 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  39.39 
 
 		 474 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  38.07 
 
 		 476 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  41.08 
 
 		 476 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  39.8 
 
 		 516 aa  302  8.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  39.07 
 
 		 481 aa  302  8.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  37.57 
 
 		 482 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  42.75 
 
 		 496 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  38.67 
 
 		 537 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  41.08 
 
 		 476 aa  302  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  38.32 
 
 		 504 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  42.07 
 
 		 496 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  42.12 
 
 		 485 aa  301  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  39.37 
 
 		 473 aa  300  5e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  40.39 
 
 		 477 aa  300  6e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  40.39 
 
 		 477 aa  300  6e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  39.27 
 
 		 479 aa  299  9e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  39.6 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  39.84 
 
 		 474 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  38.74 
 
 		 501 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  37.33 
 
 		 505 aa  298  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>