More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0606 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1733  protease Do  72.69 
 
 
522 aa  713    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  100 
 
 
523 aa  1036    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  64.15 
 
 
511 aa  610  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  63.47 
 
 
500 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  64.08 
 
 
501 aa  597  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  63.73 
 
 
511 aa  593  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  63.73 
 
 
511 aa  593  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  64.19 
 
 
516 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  58 
 
 
497 aa  528  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  58.97 
 
 
501 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  57 
 
 
496 aa  524  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  57.4 
 
 
498 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  55.97 
 
 
499 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  57.38 
 
 
497 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  56.99 
 
 
498 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  54.68 
 
 
498 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  49.81 
 
 
524 aa  473  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  50.99 
 
 
588 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  50.94 
 
 
520 aa  475  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  49.63 
 
 
524 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  50.1 
 
 
578 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  50.74 
 
 
528 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  50.93 
 
 
471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  49.9 
 
 
487 aa  447  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  52.11 
 
 
508 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  51.14 
 
 
502 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  46.98 
 
 
496 aa  415  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  49.15 
 
 
514 aa  406  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  48.94 
 
 
501 aa  396  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  46.15 
 
 
535 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  47.03 
 
 
493 aa  382  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  45.92 
 
 
493 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  45.92 
 
 
506 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  47.05 
 
 
499 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  44.49 
 
 
515 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  43.53 
 
 
491 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  43.8 
 
 
483 aa  349  8e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  44.37 
 
 
476 aa  349  8e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  44.2 
 
 
459 aa  348  2e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  43.04 
 
 
518 aa  338  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  42.74 
 
 
483 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  42.54 
 
 
483 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  43.46 
 
 
489 aa  334  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  42.58 
 
 
529 aa  333  4e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  42.89 
 
 
524 aa  333  5e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  42.86 
 
 
509 aa  333  6e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  43.31 
 
 
517 aa  331  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  43.71 
 
 
457 aa  331  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  41.03 
 
 
491 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  40.49 
 
 
520 aa  327  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  44.94 
 
 
508 aa  327  5e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  42.86 
 
 
501 aa  326  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  40.66 
 
 
513 aa  326  7e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  40.66 
 
 
513 aa  326  7e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  40.73 
 
 
527 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  42.4 
 
 
500 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  41.4 
 
 
501 aa  319  9e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  41.13 
 
 
464 aa  317  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  40.74 
 
 
475 aa  317  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  42.36 
 
 
523 aa  317  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  44.78 
 
 
496 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  40.13 
 
 
527 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  42.35 
 
 
502 aa  313  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  39.25 
 
 
497 aa  312  7.999999999999999e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  44.86 
 
 
527 aa  312  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  41 
 
 
526 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  42.83 
 
 
458 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  44.53 
 
 
496 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  40.29 
 
 
477 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  40.9 
 
 
501 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  38.1 
 
 
523 aa  310  5e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  37.16 
 
 
505 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  40.33 
 
 
477 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  39.17 
 
 
492 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  45.29 
 
 
496 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  40.67 
 
 
525 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  39.67 
 
 
479 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  40.83 
 
 
528 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  38.81 
 
 
506 aa  305  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  40.55 
 
 
528 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  41.74 
 
 
503 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  39.83 
 
 
482 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  41.74 
 
 
503 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  40.17 
 
 
482 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  40.16 
 
 
466 aa  302  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  42.25 
 
 
504 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  40.26 
 
 
520 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  37.47 
 
 
476 aa  300  5e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  39.96 
 
 
481 aa  299  6e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  38.2 
 
 
485 aa  300  6e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  40.2 
 
 
516 aa  297  3e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  38.65 
 
 
477 aa  295  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  38.65 
 
 
477 aa  295  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  38.87 
 
 
464 aa  294  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  39.15 
 
 
473 aa  294  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  40.13 
 
 
525 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  41.55 
 
 
462 aa  293  6e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  39.16 
 
 
473 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  40.13 
 
 
461 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  41.28 
 
 
510 aa  291  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>