More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1019 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  77.58 
 
 		 520 aa  775    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  100 
 
 		 525 aa  1043    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  56.16 
 
 		 526 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  55.31 
 
 		 527 aa  535  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  55.99 
 
 		 523 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  55.66 
 
 		 528 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  55.41 
 
 		 528 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  55.7 
 
 		 523 aa  523  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  55.47 
 
 		 516 aa  504  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  53.11 
 
 		 504 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  51.61 
 
 		 502 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  53.2 
 
 		 508 aa  463  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  53.56 
 
 		 501 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  52.63 
 
 		 503 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  49.13 
 
 		 529 aa  441  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  52.63 
 
 		 503 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  50.57 
 
 		 524 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  52.92 
 
 		 496 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  49.9 
 
 		 520 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  52.44 
 
 		 496 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  52.29 
 
 		 513 aa  428  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  52.29 
 
 		 513 aa  428  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  51.8 
 
 		 496 aa  425  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  47.31 
 
 		 537 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  45.33 
 
 		 517 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  49 
 
 		 491 aa  401  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  46.5 
 
 		 505 aa  392  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  45.05 
 
 		 527 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  44.69 
 
 		 527 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  45.72 
 
 		 491 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  51.34 
 
 		 509 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  46.69 
 
 		 483 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  46.49 
 
 		 483 aa  365  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  44.83 
 
 		 483 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  43.24 
 
 		 501 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  44.7 
 
 		 535 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  46.62 
 
 		 498 aa  336  7e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  42.45 
 
 		 506 aa  336  7e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  42.44 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  43.55 
 
 		 514 aa  331  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  43.13 
 
 		 471 aa  323  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  42.37 
 
 		 506 aa  323  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  42.37 
 
 		 493 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  40.16 
 
 		 487 aa  321  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  42.92 
 
 		 501 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  45.73 
 
 		 498 aa  316  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  46.08 
 
 		 501 aa  316  9e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  47.64 
 
 		 524 aa  312  7.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  45.78 
 
 		 497 aa  312  7.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  42.58 
 
 		 511 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  41.96 
 
 		 518 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  42.59 
 
 		 528 aa  311  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  38.64 
 
 		 522 aa  310  4e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  44.39 
 
 		 497 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  42.5 
 
 		 476 aa  306  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  40 
 
 		 500 aa  306  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  43.25 
 
 		 508 aa  306  7e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  40.72 
 
 		 493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  43.96 
 
 		 496 aa  302  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  40.29 
 
 		 501 aa  302  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  36.52 
 
 		 588 aa  299  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  46.3 
 
 		 462 aa  299  9e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  41.56 
 
 		 511 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  40.38 
 
 		 501 aa  298  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  45.84 
 
 		 516 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  37.87 
 
 		 520 aa  298  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  39.11 
 
 		 523 aa  297  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  41.14 
 
 		 511 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  42.22 
 
 		 464 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  42.52 
 
 		 524 aa  294  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  37.9 
 
 		 524 aa  292  9e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  37.9 
 
 		 524 aa  292  9e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  36.06 
 
 		 497 aa  292  1e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  39.71 
 
 		 508 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  40.43 
 
 		 498 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  37.6 
 
 		 499 aa  291  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  39.26 
 
 		 499 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  38.8 
 
 		 510 aa  288  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  38.84 
 
 		 485 aa  288  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  39.43 
 
 		 496 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  40.05 
 
 		 476 aa  286  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  39.63 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  39.7 
 
 		 457 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  40.7 
 
 		 475 aa  285  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  40.12 
 
 		 473 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  41.74 
 
 		 472 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  38.11 
 
 		 515 aa  281  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  38.7 
 
 		 481 aa  280  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  39.92 
 
 		 513 aa  279  9e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  38.34 
 
 		 503 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  41.5 
 
 		 471 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  39.86 
 
 		 476 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  39.79 
 
 		 505 aa  277  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  39.31 
 
 		 485 aa  277  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  38.83 
 
 		 489 aa  276  6e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  41.65 
 
 		 476 aa  276  7e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  41.56 
 
 		 476 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  40.37 
 
 		 480 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  39.92 
 
 		 458 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  41.11 
 
 		 482 aa  274  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>