More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3889 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3889  protease Do  100 
 
 		 524 aa  1027    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  42.5 
 
 		 513 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  42.5 
 
 		 513 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  44.51 
 
 		 491 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  41.92 
 
 		 520 aa  336  7.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  39.42 
 
 		 527 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  42.44 
 
 		 501 aa  330  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  41.83 
 
 		 517 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  39.34 
 
 		 527 aa  326  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  41.76 
 
 		 506 aa  322  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  42.08 
 
 		 518 aa  320  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  42.67 
 
 		 502 aa  317  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  40.36 
 
 		 505 aa  317  4e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  41.93 
 
 		 526 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  41.13 
 
 		 523 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  42.37 
 
 		 504 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  42.71 
 
 		 508 aa  312  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  42.86 
 
 		 510 aa  311  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  41.42 
 
 		 496 aa  310  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  37.86 
 
 		 527 aa  309  9e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  38.93 
 
 		 528 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  41.42 
 
 		 496 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  40.04 
 
 		 523 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  41.18 
 
 		 496 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2247  peptidase S1C, Do  40.17 
 
 		 497 aa  305  9.000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  40.54 
 
 		 503 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  40.33 
 
 		 503 aa  302  9e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  40.71 
 
 		 501 aa  302  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  38.6 
 
 		 528 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  40 
 
 		 514 aa  301  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  40.29 
 
 		 487 aa  299  8e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  41.14 
 
 		 529 aa  299  9e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  41.72 
 
 		 471 aa  299  9e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  41.08 
 
 		 491 aa  298  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  40.67 
 
 		 493 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  41.87 
 
 		 516 aa  298  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  42.4 
 
 		 525 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  42.02 
 
 		 501 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  41.53 
 
 		 508 aa  296  6e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  41.68 
 
 		 520 aa  296  8e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  39.92 
 
 		 509 aa  295  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  40.13 
 
 		 499 aa  293  4e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  40.42 
 
 		 506 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  39.87 
 
 		 493 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  40.37 
 
 		 524 aa  291  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  40.85 
 
 		 497 aa  289  9e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  44.11 
 
 		 498 aa  289  9e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  40.37 
 
 		 508 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  41.2 
 
 		 496 aa  288  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  39.87 
 
 		 515 aa  287  4e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  40.75 
 
 		 498 aa  286  5.999999999999999e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  40.28 
 
 		 524 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  40.28 
 
 		 524 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  41.61 
 
 		 501 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  41.59 
 
 		 497 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  40.99 
 
 		 511 aa  282  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  39.36 
 
 		 501 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  40.26 
 
 		 500 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  39.84 
 
 		 535 aa  280  4e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  40.39 
 
 		 500 aa  280  7e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  37.5 
 
 		 537 aa  278  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  40.8 
 
 		 523 aa  277  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.19 
 
 		 476 aa  277  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  38.66 
 
 		 520 aa  276  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  40.6 
 
 		 516 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  39.24 
 
 		 474 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  39.63 
 
 		 483 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  38.19 
 
 		 483 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  39.45 
 
 		 474 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  37.99 
 
 		 483 aa  273  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  40.71 
 
 		 499 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  40.26 
 
 		 501 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  42.27 
 
 		 524 aa  270  4e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  41.32 
 
 		 481 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  41.04 
 
 		 498 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  37.34 
 
 		 528 aa  269  8e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  39.19 
 
 		 477 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  39.87 
 
 		 513 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  39.03 
 
 		 479 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  40.5 
 
 		 511 aa  265  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  38.98 
 
 		 492 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  39.4 
 
 		 473 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  39.91 
 
 		 459 aa  264  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  38.28 
 
 		 522 aa  264  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  40.55 
 
 		 511 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  38.66 
 
 		 477 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  38.19 
 
 		 477 aa  262  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  38.19 
 
 		 477 aa  262  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  39.45 
 
 		 485 aa  261  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  37.55 
 
 		 482 aa  259  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  37.61 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  37.61 
 
 		 502 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  37.61 
 
 		 502 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  37.61 
 
 		 502 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  37.61 
 
 		 502 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  37.61 
 
 		 502 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  37.61 
 
 		 474 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  38.72 
 
 		 525 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  37.61 
 
 		 485 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  37.98 
 
 		 471 aa  258  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>