More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1368 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  66.2 
 
 		 527 aa  646    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  100 
 
 		 491 aa  975    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  66.2 
 
 		 527 aa  646    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  65.57 
 
 		 517 aa  629  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  59.26 
 
 		 520 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  60.25 
 
 		 513 aa  558  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  60.25 
 
 		 513 aa  558  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  52.35 
 
 		 505 aa  462  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  53.29 
 
 		 509 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  49.9 
 
 		 523 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  49.49 
 
 		 504 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  50.21 
 
 		 516 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  49.68 
 
 		 523 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  50 
 
 		 502 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  49.37 
 
 		 527 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  49.09 
 
 		 520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  48.75 
 
 		 525 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  49.16 
 
 		 528 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  47.14 
 
 		 529 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  49.39 
 
 		 524 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  48.95 
 
 		 526 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  48.89 
 
 		 508 aa  398  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  47.84 
 
 		 528 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  46.46 
 
 		 491 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  48.23 
 
 		 501 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  48.99 
 
 		 503 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  48.79 
 
 		 503 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  47.91 
 
 		 537 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  46.79 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  45.64 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  45.75 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  42.89 
 
 		 501 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  41.87 
 
 		 500 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  41.23 
 
 		 506 aa  348  2e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  41.84 
 
 		 520 aa  345  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  41.65 
 
 		 508 aa  343  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  45.38 
 
 		 524 aa  341  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  42.01 
 
 		 523 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  47.21 
 
 		 498 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  42.74 
 
 		 483 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  44.09 
 
 		 514 aa  337  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  46.83 
 
 		 497 aa  336  5.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  45.82 
 
 		 483 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  43.17 
 
 		 511 aa  335  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  46.35 
 
 		 498 aa  335  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  45.82 
 
 		 483 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  48.59 
 
 		 497 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  41.25 
 
 		 524 aa  334  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  41.25 
 
 		 524 aa  333  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  42.62 
 
 		 471 aa  333  4e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  41.62 
 
 		 496 aa  332  9e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  43.33 
 
 		 528 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  47.7 
 
 		 501 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  45.19 
 
 		 516 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  41.63 
 
 		 487 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  43.23 
 
 		 511 aa  327  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  43.23 
 
 		 511 aa  327  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  42.74 
 
 		 501 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  39.48 
 
 		 476 aa  324  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  43.21 
 
 		 522 aa  323  4e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  47.07 
 
 		 498 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  42.98 
 
 		 500 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  46.96 
 
 		 499 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  41.84 
 
 		 501 aa  319  7e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  40.91 
 
 		 535 aa  315  8e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  41.63 
 
 		 493 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  41.68 
 
 		 506 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  41.68 
 
 		 493 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  40.46 
 
 		 508 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  42.19 
 
 		 518 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  45.55 
 
 		 524 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  41.62 
 
 		 510 aa  304  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  39.92 
 
 		 501 aa  301  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2247  peptidase S1C, Do  39.43 
 
 		 497 aa  301  1e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  41.02 
 
 		 496 aa  300  4e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  38.66 
 
 		 515 aa  300  4e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  39.69 
 
 		 476 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  38.89 
 
 		 457 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  38.33 
 
 		 588 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  36.94 
 
 		 482 aa  296  6e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  40.75 
 
 		 455 aa  296  7e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  41.67 
 
 		 455 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  40.34 
 
 		 492 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  38.41 
 
 		 479 aa  294  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  41.44 
 
 		 455 aa  294  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  41.44 
 
 		 455 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  41.44 
 
 		 455 aa  293  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  41.44 
 
 		 455 aa  293  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  41.44 
 
 		 455 aa  293  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  41.44 
 
 		 455 aa  293  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  40.34 
 
 		 477 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  39.23 
 
 		 458 aa  293  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  41.44 
 
 		 455 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  41.44 
 
 		 455 aa  293  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  41.37 
 
 		 485 aa  292  8e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  40.13 
 
 		 477 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  40.6 
 
 		 578 aa  292  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  40.22 
 
 		 479 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  39.14 
 
 		 451 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  39.69 
 
 		 455 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>