More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3443 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  79.85 
 
 		 523 aa  793    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  71.81 
 
 		 516 aa  700    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  100 
 
 		 528 aa  1045    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  80.68 
 
 		 528 aa  808    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  78.24 
 
 		 527 aa  786    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  91.87 
 
 		 526 aa  951    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  73.82 
 
 		 523 aa  752    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  56.66 
 
 		 520 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  60.17 
 
 		 525 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  54.08 
 
 		 529 aa  478  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  53.2 
 
 		 537 aa  472  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  54.25 
 
 		 524 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  50.87 
 
 		 502 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  50.97 
 
 		 504 aa  465  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  52.93 
 
 		 501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  51.97 
 
 		 520 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  53.03 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  53.03 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  51.57 
 
 		 508 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  51.66 
 
 		 496 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  51.25 
 
 		 503 aa  432  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  51.25 
 
 		 503 aa  432  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  50.81 
 
 		 496 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  51.24 
 
 		 496 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  46.68 
 
 		 527 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  47.77 
 
 		 517 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  45.47 
 
 		 527 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  47.84 
 
 		 491 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  47.8 
 
 		 491 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  45.83 
 
 		 505 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  45.58 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  45.78 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  46.3 
 
 		 483 aa  362  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  48.68 
 
 		 509 aa  362  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  43.74 
 
 		 506 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  43.74 
 
 		 493 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  44.01 
 
 		 487 aa  353  2.9999999999999997e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  43.01 
 
 		 506 aa  353  4e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  42.07 
 
 		 493 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  42.5 
 
 		 514 aa  344  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  43.55 
 
 		 535 aa  341  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  40.94 
 
 		 508 aa  340  4e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  41.95 
 
 		 501 aa  333  4e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  42.37 
 
 		 501 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  42.58 
 
 		 508 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  42.89 
 
 		 497 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  43.01 
 
 		 496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  41.77 
 
 		 500 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  42.31 
 
 		 511 aa  322  8e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  41.58 
 
 		 528 aa  320  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  48.47 
 
 		 524 aa  319  6e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  41.45 
 
 		 464 aa  319  7e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  39.36 
 
 		 588 aa  319  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  41.83 
 
 		 498 aa  318  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  41.38 
 
 		 515 aa  315  9.999999999999999e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  43.61 
 
 		 485 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  42.64 
 
 		 501 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  39.02 
 
 		 500 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  40.71 
 
 		 501 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  41.34 
 
 		 524 aa  310  4e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  43.16 
 
 		 498 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  42.74 
 
 		 511 aa  310  4e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  39.75 
 
 		 520 aa  310  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  39.63 
 
 		 524 aa  310  5.9999999999999995e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  42.74 
 
 		 511 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  40.46 
 
 		 518 aa  309  8e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  40.83 
 
 		 523 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  41.32 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  41.88 
 
 		 497 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  39.54 
 
 		 499 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  44.85 
 
 		 498 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  41.73 
 
 		 499 aa  306  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  39.43 
 
 		 524 aa  306  8.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.42 
 
 		 476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  40.89 
 
 		 516 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  40.17 
 
 		 471 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  38.49 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  40.46 
 
 		 472 aa  301  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  38.96 
 
 		 522 aa  298  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  39.52 
 
 		 493 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  39.52 
 
 		 493 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  41.92 
 
 		 488 aa  297  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  39.11 
 
 		 501 aa  297  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  39.3 
 
 		 494 aa  297  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  39.43 
 
 		 493 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  40.99 
 
 		 502 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  40.99 
 
 		 502 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  40.99 
 
 		 502 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  40.86 
 
 		 462 aa  296  6e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  40.99 
 
 		 502 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  40.99 
 
 		 502 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  40.31 
 
 		 483 aa  296  8e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  40.99 
 
 		 485 aa  296  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  40.31 
 
 		 483 aa  296  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  40.31 
 
 		 483 aa  296  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  39.69 
 
 		 459 aa  296  8e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  40.97 
 
 		 458 aa  295  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  40.04 
 
 		 495 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  40.04 
 
 		 495 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  40.04 
 
 		 495 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>