More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0637 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  68.95 
 
 		 527 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  100 
 
 		 517 aa  1025    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  70.36 
 
 		 527 aa  717    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  64.96 
 
 		 491 aa  623  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  61.19 
 
 		 520 aa  598  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  60.73 
 
 		 513 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  60.73 
 
 		 513 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  51.17 
 
 		 505 aa  493  9.999999999999999e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  54.93 
 
 		 509 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  48.57 
 
 		 504 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  48.74 
 
 		 502 aa  428  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  45.63 
 
 		 529 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  47.41 
 
 		 527 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  49.26 
 
 		 516 aa  421  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  45.85 
 
 		 520 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  47.06 
 
 		 523 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  46.18 
 
 		 523 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  45.49 
 
 		 524 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  47.25 
 
 		 501 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  47.77 
 
 		 526 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  46.77 
 
 		 508 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  47.03 
 
 		 525 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  47.13 
 
 		 528 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  46.58 
 
 		 491 aa  402  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  46.34 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  43.51 
 
 		 528 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  46.54 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  46.03 
 
 		 496 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  45.62 
 
 		 496 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  45.95 
 
 		 496 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  44.13 
 
 		 537 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  41.48 
 
 		 501 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  42.58 
 
 		 500 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  44.84 
 
 		 524 aa  359  8e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  44.84 
 
 		 524 aa  359  8e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  41.89 
 
 		 520 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  43.62 
 
 		 511 aa  349  6e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  43.04 
 
 		 506 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  47.55 
 
 		 501 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  42.83 
 
 		 493 aa  347  4e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  46.95 
 
 		 498 aa  346  5e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  45.32 
 
 		 508 aa  346  6e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  47.07 
 
 		 497 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  43.44 
 
 		 496 aa  342  7e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  41.18 
 
 		 506 aa  342  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  47.72 
 
 		 498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  43.68 
 
 		 535 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  41.33 
 
 		 483 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  45.27 
 
 		 471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  42.21 
 
 		 493 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  46.42 
 
 		 497 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  41.68 
 
 		 483 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  42.8 
 
 		 511 aa  336  5e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  41.48 
 
 		 483 aa  336  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  43.06 
 
 		 499 aa  336  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  42.8 
 
 		 511 aa  335  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  40.67 
 
 		 487 aa  335  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  43.54 
 
 		 523 aa  334  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  47.43 
 
 		 498 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  42.74 
 
 		 501 aa  334  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  42.32 
 
 		 522 aa  332  9e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  43.49 
 
 		 516 aa  332  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  39.67 
 
 		 528 aa  331  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  41.09 
 
 		 500 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  42.68 
 
 		 514 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  42.41 
 
 		 524 aa  328  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  40.29 
 
 		 482 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  46.85 
 
 		 524 aa  325  9e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  38.54 
 
 		 588 aa  322  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  38.25 
 
 		 508 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  37.28 
 
 		 476 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  42.04 
 
 		 497 aa  313  4.999999999999999e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  40.54 
 
 		 501 aa  313  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  38.12 
 
 		 481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  42.07 
 
 		 499 aa  310  4e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  38.01 
 
 		 492 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  38.76 
 
 		 457 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  40.18 
 
 		 496 aa  309  6.999999999999999e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  39.06 
 
 		 501 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  38.33 
 
 		 479 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  40.33 
 
 		 502 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  39.5 
 
 		 518 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  38.28 
 
 		 477 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  48.63 
 
 		 578 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  37.94 
 
 		 477 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  37.94 
 
 		 477 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  40.17 
 
 		 515 aa  306  7e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  38.13 
 
 		 477 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  39.16 
 
 		 458 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  40.17 
 
 		 475 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  41.81 
 
 		 485 aa  299  8e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  39.81 
 
 		 510 aa  299  8e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  38.29 
 
 		 474 aa  297  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  38.48 
 
 		 481 aa  296  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  36.49 
 
 		 482 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  37.33 
 
 		 474 aa  294  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  38.02 
 
 		 464 aa  294  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2247  peptidase S1C, Do  38.26 
 
 		 497 aa  293  6e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  37.52 
 
 		 474 aa  293  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  37.87 
 
 		 473 aa  292  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>