More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0837 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0837  protease Do  100 
 
 
476 aa  954    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  59.35 
 
 
473 aa  543  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  58.33 
 
 
481 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  55.17 
 
 
482 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  55.07 
 
 
480 aa  475  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  53.64 
 
 
475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  47.45 
 
 
458 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  47.91 
 
 
457 aa  395  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  46.02 
 
 
464 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  45.61 
 
 
476 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  44.42 
 
 
461 aa  360  4e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  44.71 
 
 
491 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  43.86 
 
 
466 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  44.7 
 
 
464 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  45.66 
 
 
462 aa  355  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  45.03 
 
 
471 aa  352  7e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  43.87 
 
 
485 aa  350  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  46 
 
 
485 aa  348  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  43.99 
 
 
478 aa  346  6e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  45.12 
 
 
475 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  43.24 
 
 
476 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  43.24 
 
 
476 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  42.24 
 
 
508 aa  339  7e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  42.56 
 
 
474 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  42.36 
 
 
474 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  43.22 
 
 
489 aa  335  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  41.37 
 
 
476 aa  334  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  42.14 
 
 
499 aa  332  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  41.84 
 
 
474 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  44.82 
 
 
509 aa  331  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  43.11 
 
 
493 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  41.87 
 
 
500 aa  329  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  41.15 
 
 
469 aa  328  9e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  40.95 
 
 
473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  41.41 
 
 
472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  41.77 
 
 
473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  42.14 
 
 
483 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  43.08 
 
 
474 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  42.45 
 
 
493 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  42.14 
 
 
483 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  42.45 
 
 
506 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  38.97 
 
 
527 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  40.6 
 
 
479 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  39.96 
 
 
477 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  39.67 
 
 
491 aa  319  7e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  41.27 
 
 
515 aa  319  7e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  42.29 
 
 
501 aa  319  7.999999999999999e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  42.26 
 
 
511 aa  318  9e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  42.48 
 
 
502 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  40.82 
 
 
481 aa  318  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  39.96 
 
 
477 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  39.75 
 
 
492 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  39.51 
 
 
478 aa  316  7e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  39.79 
 
 
473 aa  316  7e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  43.89 
 
 
497 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  37.09 
 
 
517 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  39.96 
 
 
477 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  39.96 
 
 
477 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  36.74 
 
 
527 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  39.26 
 
 
482 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  40.04 
 
 
473 aa  311  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  40.04 
 
 
464 aa  311  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  40.9 
 
 
501 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  41.38 
 
 
514 aa  310  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  40.88 
 
 
487 aa  310  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  42.11 
 
 
535 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  39.31 
 
 
588 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  42.7 
 
 
525 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  39.53 
 
 
514 aa  309  6.999999999999999e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  42.63 
 
 
502 aa  309  6.999999999999999e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  40.17 
 
 
513 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  40.17 
 
 
513 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  39.52 
 
 
491 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  42.44 
 
 
500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  42.24 
 
 
500 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  43.11 
 
 
471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  42.89 
 
 
472 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  39.7 
 
 
494 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  44.9 
 
 
524 aa  307  3e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  39.69 
 
 
479 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  42.7 
 
 
504 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  40.55 
 
 
483 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  40.22 
 
 
483 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  40.22 
 
 
495 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  40.22 
 
 
495 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  40.22 
 
 
483 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  40.22 
 
 
495 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  40.22 
 
 
483 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  40.22 
 
 
495 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  40.29 
 
 
479 aa  306  7e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  38.83 
 
 
504 aa  306  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  42.92 
 
 
527 aa  306  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  38.91 
 
 
503 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  39.7 
 
 
494 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  39.75 
 
 
473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  41.84 
 
 
511 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  40.22 
 
 
495 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  41.27 
 
 
528 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  45.26 
 
 
502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  39.54 
 
 
481 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>