More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0210 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0210  serine protease  100 
 
 
497 aa  1007    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  45 
 
 
479 aa  392  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  42.95 
 
 
506 aa  346  4e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  42.15 
 
 
502 aa  342  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  39.41 
 
 
504 aa  342  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  39.45 
 
 
498 aa  340  5e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  43.02 
 
 
474 aa  339  8e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  41.72 
 
 
505 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  43.2 
 
 
471 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  44.47 
 
 
499 aa  334  3e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  44.34 
 
 
457 aa  333  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  44.24 
 
 
458 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  42.61 
 
 
476 aa  330  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  41.72 
 
 
502 aa  329  8e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  41.07 
 
 
476 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  42.11 
 
 
476 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.81 
 
 
476 aa  323  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  40.94 
 
 
475 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  44.34 
 
 
476 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  43.18 
 
 
464 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  42.33 
 
 
513 aa  318  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  43.85 
 
 
485 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  44.82 
 
 
460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  45.12 
 
 
475 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  44.67 
 
 
458 aa  313  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  44.21 
 
 
511 aa  312  9e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  40.58 
 
 
473 aa  312  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  42.07 
 
 
478 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  40.43 
 
 
466 aa  310  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  41.72 
 
 
472 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  38.48 
 
 
498 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  38.48 
 
 
498 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  38.48 
 
 
498 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  39.68 
 
 
483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  43.01 
 
 
464 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  38.35 
 
 
467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  41.88 
 
 
484 aa  307  3e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  43.07 
 
 
502 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  38.35 
 
 
499 aa  306  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  41.83 
 
 
476 aa  306  8.000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  43.21 
 
 
504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  41.09 
 
 
464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  41.3 
 
 
509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  38.14 
 
 
499 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  39.77 
 
 
485 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  38.87 
 
 
520 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  39.31 
 
 
502 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  39.31 
 
 
502 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  39.96 
 
 
503 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  39.31 
 
 
502 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  42.89 
 
 
491 aa  303  4.0000000000000003e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  41.23 
 
 
469 aa  303  5.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  39.31 
 
 
485 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  39.31 
 
 
502 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  39.31 
 
 
502 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  39.31 
 
 
461 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  40.75 
 
 
481 aa  302  9e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  39.18 
 
 
483 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  38.95 
 
 
483 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  39.52 
 
 
503 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  36.64 
 
 
481 aa  301  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  38.71 
 
 
513 aa  300  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  38.71 
 
 
513 aa  300  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  37.68 
 
 
500 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  40.52 
 
 
464 aa  300  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  40.09 
 
 
500 aa  300  5e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  42.11 
 
 
473 aa  300  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  40.14 
 
 
490 aa  300  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  40.43 
 
 
500 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  39.47 
 
 
474 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  39.4 
 
 
496 aa  299  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  40.74 
 
 
465 aa  298  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  41.38 
 
 
480 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  39.25 
 
 
474 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  41.72 
 
 
461 aa  297  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  39.36 
 
 
498 aa  297  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  37.5 
 
 
472 aa  297  3e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  44.95 
 
 
469 aa  297  4e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  41.59 
 
 
525 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  41.28 
 
 
462 aa  296  6e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  37.74 
 
 
505 aa  296  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  38.77 
 
 
474 aa  296  7e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  36.69 
 
 
507 aa  296  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  36.55 
 
 
505 aa  295  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  43.73 
 
 
474 aa  295  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  43.73 
 
 
474 aa  295  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  41.33 
 
 
489 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  41.39 
 
 
485 aa  294  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  37.18 
 
 
527 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  42.09 
 
 
450 aa  295  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  41.15 
 
 
461 aa  294  2e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  39 
 
 
495 aa  294  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  37.77 
 
 
485 aa  294  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  42.79 
 
 
473 aa  294  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  38.2 
 
 
491 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  40.05 
 
 
467 aa  293  5e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  40 
 
 
514 aa  293  5e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  38.82 
 
 
479 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  40.66 
 
 
501 aa  292  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  37.47 
 
 
514 aa  292  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>