More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4295 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4295  protease Do  100 
 
 
466 aa  934    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  64.36 
 
 
457 aa  598  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  64.03 
 
 
464 aa  600  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  66.88 
 
 
464 aa  591  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  65.23 
 
 
458 aa  588  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  58.62 
 
 
472 aa  498  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  55.41 
 
 
461 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  52.52 
 
 
476 aa  450  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  53.67 
 
 
462 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  52.16 
 
 
485 aa  411  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  46.52 
 
 
476 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  47.17 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  46.31 
 
 
476 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  47.39 
 
 
489 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  46.51 
 
 
478 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  48.4 
 
 
472 aa  395  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  46.9 
 
 
473 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  47.8 
 
 
485 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  47.14 
 
 
476 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  45.93 
 
 
474 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  46.8 
 
 
475 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  44.42 
 
 
476 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  46.88 
 
 
481 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  43.87 
 
 
481 aa  372  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  47.03 
 
 
482 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  44.14 
 
 
469 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  44.3 
 
 
484 aa  363  5.0000000000000005e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  45.05 
 
 
480 aa  359  6e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  43.91 
 
 
477 aa  359  7e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  42.37 
 
 
478 aa  358  9e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  44.49 
 
 
524 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  43.64 
 
 
464 aa  355  6.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  45.16 
 
 
473 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  43.46 
 
 
473 aa  351  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  43.48 
 
 
483 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  42.34 
 
 
473 aa  346  6e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  44.87 
 
 
475 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  44.79 
 
 
511 aa  345  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  44.49 
 
 
523 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  41.53 
 
 
487 aa  343  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  43.54 
 
 
473 aa  342  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  42.83 
 
 
500 aa  342  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  44.28 
 
 
524 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  41.35 
 
 
483 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  41.14 
 
 
483 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  43.15 
 
 
479 aa  339  7e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  42.8 
 
 
474 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  42.8 
 
 
474 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  44.7 
 
 
502 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  44.65 
 
 
511 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  44.65 
 
 
511 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  44.3 
 
 
471 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  46.15 
 
 
471 aa  336  5e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  42.98 
 
 
479 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  39.38 
 
 
524 aa  334  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  43.55 
 
 
525 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  43.41 
 
 
474 aa  333  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  39.38 
 
 
524 aa  332  6e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  41.24 
 
 
477 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  41.24 
 
 
477 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  41.58 
 
 
501 aa  332  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  40.87 
 
 
506 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  43.4 
 
 
497 aa  331  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  48.7 
 
 
578 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  40.87 
 
 
493 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  43.31 
 
 
508 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  43.42 
 
 
501 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  41.06 
 
 
459 aa  330  3e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  41.34 
 
 
498 aa  329  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  41.89 
 
 
496 aa  328  9e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  42.3 
 
 
477 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  49.4 
 
 
588 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0037  protease Do  40.25 
 
 
489 aa  327  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  39.87 
 
 
493 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  41.67 
 
 
482 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  43.23 
 
 
528 aa  326  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  42.52 
 
 
477 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  42.52 
 
 
492 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  42.13 
 
 
467 aa  326  6e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  39.38 
 
 
520 aa  326  7e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  42.98 
 
 
499 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  41.56 
 
 
492 aa  325  9e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  42.19 
 
 
516 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  42.67 
 
 
487 aa  323  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  44.04 
 
 
498 aa  322  7e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  44.26 
 
 
501 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  43.41 
 
 
497 aa  322  8e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  41.86 
 
 
506 aa  322  8e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  40.84 
 
 
514 aa  321  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  39.16 
 
 
491 aa  320  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  42.07 
 
 
481 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  43.38 
 
 
497 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  43.61 
 
 
492 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  43.61 
 
 
492 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  40.8 
 
 
479 aa  320  5e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  40.83 
 
 
473 aa  320  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  41.74 
 
 
502 aa  319  7e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  41.65 
 
 
535 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  41.47 
 
 
502 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  41.47 
 
 
502 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>