More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2815 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2815  protease Do  100 
 
 		 485 aa  978    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  47.61 
 
 		 476 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  48.15 
 
 		 457 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  50.87 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  47.7 
 
 		 464 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  48.37 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  48.15 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  48.37 
 
 		 475 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  50 
 
 		 462 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  44.18 
 
 		 461 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  47.05 
 
 		 473 aa  382  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  45.84 
 
 		 476 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  47.54 
 
 		 480 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  47.92 
 
 		 482 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  45.59 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  43.43 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  46.92 
 
 		 481 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  44.68 
 
 		 478 aa  359  7e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  44.9 
 
 		 476 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  44.8 
 
 		 476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  43.62 
 
 		 475 aa  356  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  46.83 
 
 		 472 aa  355  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  43.59 
 
 		 476 aa  352  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  43.24 
 
 		 471 aa  349  6e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  43.14 
 
 		 472 aa  347  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  43.86 
 
 		 524 aa  342  8e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  43.02 
 
 		 474 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  42.65 
 
 		 477 aa  336  5.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  43.61 
 
 		 502 aa  334  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  42.04 
 
 		 469 aa  332  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  43.86 
 
 		 523 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  41.27 
 
 		 492 aa  330  3e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  42.06 
 
 		 478 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  41.42 
 
 		 525 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  41.63 
 
 		 491 aa  327  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  41.48 
 
 		 511 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  43.17 
 
 		 471 aa  326  6e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  42.98 
 
 		 524 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  43.5 
 
 		 474 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  39.39 
 
 		 522 aa  323  5e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  43.63 
 
 		 528 aa  322  7e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  41.18 
 
 		 473 aa  322  7e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  41.8 
 
 		 504 aa  322  7e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  40.04 
 
 		 588 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  40.33 
 
 		 474 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  41.98 
 
 		 483 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  41.76 
 
 		 506 aa  320  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  43.21 
 
 		 483 aa  319  6e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  40.33 
 
 		 474 aa  319  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  40.8 
 
 		 464 aa  319  7e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  41.76 
 
 		 493 aa  319  7e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  41.39 
 
 		 492 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  41.3 
 
 		 500 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  39.58 
 
 		 578 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  41.21 
 
 		 484 aa  318  1e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  42.92 
 
 		 479 aa  317  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  41.63 
 
 		 481 aa  318  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  41.99 
 
 		 498 aa  317  3e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  39.83 
 
 		 467 aa  317  4e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  41.45 
 
 		 514 aa  317  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  39.91 
 
 		 501 aa  317  4e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  41.13 
 
 		 477 aa  316  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  41.44 
 
 		 493 aa  316  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1117  protease Do  37.58 
 
 		 491 aa  316  8e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0590546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1396  serine protease, DO/DeqQ family  37.58 
 
 		 479 aa  315  8e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.333333  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  42.66 
 
 		 516 aa  315  9e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  41.27 
 
 		 511 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  41.34 
 
 		 477 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  40.76 
 
 		 473 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  40.91 
 
 		 502 aa  314  2.9999999999999996e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  41.05 
 
 		 511 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  41.96 
 
 		 529 aa  314  2.9999999999999996e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  42.77 
 
 		 504 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  42.13 
 
 		 501 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1435  peptidase S1C, Do  40.12 
 
 		 545 aa  312  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.600827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  40.96 
 
 		 479 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  39.82 
 
 		 497 aa  312  1e-83  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  41.04 
 
 		 506 aa  311  1e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  41.04 
 
 		 473 aa  312  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  42.06 
 
 		 483 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  44 
 
 		 450 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  41.49 
 
 		 500 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  42.43 
 
 		 473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  39.21 
 
 		 487 aa  310  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  38.49 
 
 		 517 aa  309  9e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  38.89 
 
 		 523 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  38.74 
 
 		 499 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  42.86 
 
 		 471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  41.58 
 
 		 502 aa  307  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  42.44 
 
 		 501 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  40.61 
 
 		 513 aa  306  6e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  39.38 
 
 		 515 aa  305  9.000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  40.08 
 
 		 477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  40.08 
 
 		 477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  38.1 
 
 		 495 aa  305  1.0000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  39.51 
 
 		 520 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  41.99 
 
 		 482 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  39.12 
 
 		 508 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  41.53 
 
 		 505 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  38.1 
 
 		 520 aa  303  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>