More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0999 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0999  protease Do  100 
 
 
461 aa  917    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  58.92 
 
 
472 aa  500  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  54.55 
 
 
466 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  55.19 
 
 
464 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  54.35 
 
 
457 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  54.23 
 
 
458 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  54.8 
 
 
464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  50.45 
 
 
462 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  49.66 
 
 
476 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  51.34 
 
 
475 aa  378  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  45.11 
 
 
485 aa  365  1e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  44.42 
 
 
476 aa  360  4e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  47.26 
 
 
473 aa  354  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  44.95 
 
 
485 aa  347  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  43.23 
 
 
480 aa  341  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  44.1 
 
 
481 aa  338  8e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  41.93 
 
 
478 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  44.86 
 
 
489 aa  335  9e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  44.47 
 
 
477 aa  334  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  44.47 
 
 
477 aa  334  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  45.27 
 
 
483 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  45.27 
 
 
483 aa  333  5e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  43.39 
 
 
478 aa  332  8e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  42.77 
 
 
471 aa  332  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  43.7 
 
 
482 aa  331  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  44.84 
 
 
476 aa  330  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  43.44 
 
 
473 aa  330  3e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  44.6 
 
 
476 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  43.51 
 
 
476 aa  330  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  43.37 
 
 
474 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  43.29 
 
 
524 aa  322  8e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  41.83 
 
 
475 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  40.76 
 
 
492 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  41.67 
 
 
477 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  43.59 
 
 
483 aa  319  6e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  40.72 
 
 
477 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  41.93 
 
 
502 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  41.93 
 
 
502 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  43.9 
 
 
472 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  41.93 
 
 
502 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  41.93 
 
 
502 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  41.93 
 
 
502 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  43.05 
 
 
484 aa  318  1e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  43.06 
 
 
525 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  41.93 
 
 
485 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  44.47 
 
 
473 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  41.03 
 
 
479 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  41.93 
 
 
461 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  42.64 
 
 
501 aa  315  8e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  42.17 
 
 
498 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  43.01 
 
 
464 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  42.17 
 
 
498 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  42.17 
 
 
498 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  41.94 
 
 
481 aa  315  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  41.33 
 
 
485 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  41.89 
 
 
493 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  41.89 
 
 
506 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  43.68 
 
 
514 aa  313  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  42.96 
 
 
467 aa  313  5.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  41.01 
 
 
477 aa  312  6.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  41.81 
 
 
490 aa  312  9e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  40.46 
 
 
493 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  41.39 
 
 
499 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  42.54 
 
 
501 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  42.73 
 
 
506 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  40.04 
 
 
503 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  41.18 
 
 
499 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  40.33 
 
 
509 aa  310  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  40.98 
 
 
474 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  39.37 
 
 
467 aa  309  5e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  43.29 
 
 
523 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  40.98 
 
 
474 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  39.91 
 
 
501 aa  308  9e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  41.98 
 
 
493 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  40.56 
 
 
500 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  40.42 
 
 
487 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  41.59 
 
 
503 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  41.68 
 
 
508 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  43.07 
 
 
524 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  41.19 
 
 
481 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  41.08 
 
 
473 aa  307  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  40.26 
 
 
507 aa  307  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  42.36 
 
 
471 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  41.1 
 
 
518 aa  306  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  39.19 
 
 
491 aa  306  7e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  44.1 
 
 
500 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  39.96 
 
 
473 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  41.58 
 
 
479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  39.96 
 
 
490 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  42.08 
 
 
476 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  39.29 
 
 
500 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  41.53 
 
 
491 aa  303  6.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  41.31 
 
 
498 aa  303  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  42.69 
 
 
474 aa  301  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  40.09 
 
 
522 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  41.36 
 
 
516 aa  301  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  40.8 
 
 
488 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  42.92 
 
 
502 aa  300  4e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  41.47 
 
 
479 aa  300  5e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  39.61 
 
 
505 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>