More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2005 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  100 
 
 
475 aa  937    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  51.94 
 
 
476 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  48.67 
 
 
464 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  48.72 
 
 
457 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  49.88 
 
 
458 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  48.97 
 
 
462 aa  382  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  51.34 
 
 
461 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  46.1 
 
 
464 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  47.58 
 
 
485 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  46.14 
 
 
466 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  44.42 
 
 
471 aa  359  5e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  44.4 
 
 
485 aa  355  8.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  44.57 
 
 
476 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  45.23 
 
 
489 aa  351  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  44.34 
 
 
476 aa  350  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  44.74 
 
 
480 aa  348  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  43.16 
 
 
476 aa  345  7e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  45.12 
 
 
476 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  46.9 
 
 
473 aa  340  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  45.12 
 
 
472 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  44.82 
 
 
481 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  44.84 
 
 
478 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  42.44 
 
 
475 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  45.11 
 
 
524 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  43.58 
 
 
482 aa  333  3e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  44.63 
 
 
484 aa  332  1e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  42.44 
 
 
474 aa  331  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  46.92 
 
 
472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  45.09 
 
 
524 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  44.72 
 
 
506 aa  326  6e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  44.72 
 
 
493 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  42.37 
 
 
487 aa  322  7e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  44.89 
 
 
523 aa  322  9.000000000000001e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  44.84 
 
 
477 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  41.63 
 
 
525 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  42.46 
 
 
500 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  44.02 
 
 
491 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  41.92 
 
 
528 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  42.66 
 
 
483 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  42.95 
 
 
513 aa  317  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  42.66 
 
 
483 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  42.95 
 
 
513 aa  317  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  41.01 
 
 
514 aa  317  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  40.74 
 
 
523 aa  317  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  43.71 
 
 
500 aa  317  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  43.28 
 
 
493 aa  316  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  42.55 
 
 
501 aa  315  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  43.89 
 
 
464 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  42.31 
 
 
471 aa  312  7.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  39.54 
 
 
524 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  41.58 
 
 
503 aa  312  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  44.15 
 
 
518 aa  311  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  39.54 
 
 
524 aa  311  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  41.14 
 
 
503 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  42.51 
 
 
479 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  40.96 
 
 
505 aa  310  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  39.55 
 
 
520 aa  310  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  42.08 
 
 
473 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  43.87 
 
 
492 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  43.58 
 
 
473 aa  309  6.999999999999999e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  43.06 
 
 
500 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  42.86 
 
 
501 aa  309  8e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  41.99 
 
 
483 aa  309  8e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  43.87 
 
 
477 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  44.75 
 
 
504 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  44.63 
 
 
497 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  43.16 
 
 
477 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  42.72 
 
 
479 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  41.94 
 
 
477 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  41.94 
 
 
477 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  41.42 
 
 
523 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  40.67 
 
 
516 aa  306  6e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  43.14 
 
 
473 aa  306  6e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  40.5 
 
 
520 aa  305  9.000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  40.91 
 
 
494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  43.14 
 
 
504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  42.32 
 
 
501 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.24 
 
 
513 aa  304  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  41.18 
 
 
493 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  41.67 
 
 
473 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  41.18 
 
 
493 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  42.25 
 
 
511 aa  304  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  42 
 
 
481 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  42.14 
 
 
504 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  42.73 
 
 
511 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  44.42 
 
 
474 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  40.52 
 
 
499 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  43.13 
 
 
504 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  40.65 
 
 
499 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  42 
 
 
465 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  40.45 
 
 
494 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  38.4 
 
 
588 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  39.71 
 
 
502 aa  302  9e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  39.71 
 
 
502 aa  302  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  39.71 
 
 
502 aa  302  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  40.52 
 
 
502 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  40.95 
 
 
494 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  44.39 
 
 
498 aa  302  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  40.52 
 
 
502 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  42.65 
 
 
503 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>