More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1855 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  68.66 
 
 
498 aa  684    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  76.33 
 
 
505 aa  739    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  100 
 
 
504 aa  1012    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  66.73 
 
 
499 aa  640    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  64.71 
 
 
506 aa  662    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  64.67 
 
 
502 aa  664    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  63.76 
 
 
502 aa  633  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  42.01 
 
 
479 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  42.76 
 
 
471 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  41.86 
 
 
472 aa  334  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  42.83 
 
 
476 aa  332  9e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  38.92 
 
 
511 aa  332  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  41.04 
 
 
476 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  39.41 
 
 
497 aa  326  5e-88  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  41.82 
 
 
458 aa  326  6e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  41.14 
 
 
457 aa  324  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  41.67 
 
 
464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  41.53 
 
 
476 aa  320  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  41 
 
 
474 aa  319  7e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  41.5 
 
 
476 aa  319  9e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  45.29 
 
 
511 aa  318  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  43.34 
 
 
464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  39.69 
 
 
480 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  39.91 
 
 
513 aa  308  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  39.96 
 
 
465 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  38.27 
 
 
469 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  40.49 
 
 
485 aa  306  7e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  40.62 
 
 
466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  36.99 
 
 
467 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  38.8 
 
 
479 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  39.16 
 
 
473 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  42.19 
 
 
472 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  41.65 
 
 
478 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.14 
 
 
475 aa  303  5.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  39.21 
 
 
481 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  39.91 
 
 
464 aa  303  6.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  39.51 
 
 
477 aa  303  7.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  39.3 
 
 
502 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  39.3 
 
 
502 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  37.95 
 
 
482 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  38.67 
 
 
474 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  37.84 
 
 
473 aa  302  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  39.08 
 
 
485 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  39.3 
 
 
502 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  39.3 
 
 
502 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  39.3 
 
 
502 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  39.3 
 
 
461 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  39.3 
 
 
485 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  38.9 
 
 
490 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  38.28 
 
 
498 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  38.28 
 
 
498 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  38.28 
 
 
498 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  48.36 
 
 
393 aa  300  6e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  38.68 
 
 
481 aa  300  6e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  38.25 
 
 
482 aa  299  7e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  40.88 
 
 
476 aa  299  8e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  39.33 
 
 
473 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  38.33 
 
 
481 aa  299  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  37.92 
 
 
500 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  42.36 
 
 
461 aa  297  2e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  38.53 
 
 
477 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  38.08 
 
 
492 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  42.15 
 
 
471 aa  296  4e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  41.16 
 
 
404 aa  296  8e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  40.85 
 
 
461 aa  295  9e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  38.31 
 
 
477 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  43.42 
 
 
485 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  42 
 
 
524 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  40.66 
 
 
404 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  40.66 
 
 
525 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  37.77 
 
 
499 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  37.77 
 
 
499 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  36.58 
 
 
505 aa  293  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  38.43 
 
 
479 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  41.64 
 
 
471 aa  291  1e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  41.65 
 
 
460 aa  292  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  38 
 
 
474 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  40.78 
 
 
489 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  37.88 
 
 
502 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  39.43 
 
 
473 aa  290  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  37.31 
 
 
477 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  37.31 
 
 
477 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  37.78 
 
 
474 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  37.83 
 
 
467 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  42 
 
 
524 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  36.78 
 
 
473 aa  289  7e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  41.28 
 
 
507 aa  289  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  46.73 
 
 
396 aa  289  9e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  39.19 
 
 
475 aa  287  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  38.65 
 
 
478 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  40.37 
 
 
459 aa  286  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  39.9 
 
 
488 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  41.77 
 
 
523 aa  286  7e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  38.3 
 
 
503 aa  286  7e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  42.86 
 
 
450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  41.16 
 
 
509 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  39.5 
 
 
476 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  37.26 
 
 
505 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  39.91 
 
 
483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  39.91 
 
 
483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>