More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4790 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  100 
 
 
511 aa  1008    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  47.3 
 
 
502 aa  366  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  47.06 
 
 
513 aa  360  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  45.27 
 
 
502 aa  351  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  40.85 
 
 
498 aa  344  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  55.56 
 
 
393 aa  345  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  44.97 
 
 
476 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  42.5 
 
 
506 aa  342  1e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  43.71 
 
 
479 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  45.27 
 
 
505 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  39.01 
 
 
504 aa  332  8e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  40.09 
 
 
472 aa  332  1e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  45.1 
 
 
496 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  46.01 
 
 
494 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  40.31 
 
 
461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  46.44 
 
 
491 aa  325  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  43.87 
 
 
488 aa  323  5e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  44.51 
 
 
499 aa  322  7e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  44.65 
 
 
488 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  40 
 
 
476 aa  320  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  43.35 
 
 
468 aa  319  7e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  38.98 
 
 
471 aa  317  2e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  43.5 
 
 
471 aa  318  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  43.84 
 
 
464 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.25 
 
 
412 aa  317  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  39.02 
 
 
472 aa  315  8e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  43.72 
 
 
471 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  47.57 
 
 
471 aa  314  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  41.54 
 
 
463 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  43.38 
 
 
465 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  38.8 
 
 
476 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  41.51 
 
 
464 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  41.72 
 
 
464 aa  311  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  41.23 
 
 
467 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  42.72 
 
 
476 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  46.63 
 
 
392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.24 
 
 
390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  43.38 
 
 
457 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  44.74 
 
 
450 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  44.44 
 
 
458 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.86 
 
 
408 aa  309  9e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  41.97 
 
 
463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  43.28 
 
 
504 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  44.37 
 
 
458 aa  308  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  38.17 
 
 
476 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  42.08 
 
 
471 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  41.46 
 
 
474 aa  306  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  40 
 
 
471 aa  306  7e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  41.16 
 
 
478 aa  306  8.000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  44.44 
 
 
442 aa  305  9.000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  49.09 
 
 
385 aa  305  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  48.96 
 
 
398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  41.24 
 
 
464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  41.24 
 
 
497 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  44.24 
 
 
460 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  41.26 
 
 
458 aa  304  3.0000000000000004e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.85 
 
 
385 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  40.98 
 
 
500 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  40.58 
 
 
485 aa  303  6.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  41.23 
 
 
473 aa  302  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  42.44 
 
 
474 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  42.44 
 
 
474 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  39.46 
 
 
479 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  41.46 
 
 
500 aa  301  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  39.42 
 
 
481 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  42.57 
 
 
443 aa  300  4e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  39.61 
 
 
479 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.44 
 
 
442 aa  299  6e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  39.66 
 
 
474 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.76 
 
 
475 aa  299  7e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  42.24 
 
 
478 aa  299  9e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  47.73 
 
 
402 aa  299  9e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  43.78 
 
 
380 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  47.43 
 
 
402 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  39.83 
 
 
477 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  47.43 
 
 
388 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.43 
 
 
396 aa  298  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  39.22 
 
 
474 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  39.52 
 
 
492 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  42.17 
 
 
488 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.43 
 
 
401 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  47.73 
 
 
387 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  40 
 
 
525 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  47.43 
 
 
401 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  39.52 
 
 
477 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.43 
 
 
401 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  47.43 
 
 
402 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  37.92 
 
 
473 aa  297  3e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  47.75 
 
 
403 aa  297  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  48.82 
 
 
383 aa  297  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  47.43 
 
 
402 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  47.43 
 
 
402 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  47.43 
 
 
401 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  49.55 
 
 
404 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  42.15 
 
 
446 aa  297  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.43 
 
 
401 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.43 
 
 
401 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  40.67 
 
 
489 aa  296  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  40.43 
 
 
485 aa  297  4e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>