More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2343 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2343  protease DO  100 
 
 		 465 aa  927    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  55.23 
 
 		 460 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  55.63 
 
 		 457 aa  461  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  50.11 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  54.1 
 
 		 450 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3731  protease DO  53.23 
 
 		 476 aa  433  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.233243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  48.48 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  48.17 
 
 		 473 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  50.46 
 
 		 450 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  49.31 
 
 		 450 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  51.14 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  48.21 
 
 		 450 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  47.42 
 
 		 451 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  48.27 
 
 		 449 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  47.19 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  47.26 
 
 		 451 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  47.19 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  46.97 
 
 		 450 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  46.97 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  46.97 
 
 		 450 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  46.97 
 
 		 450 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  49.19 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  46.97 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  46.87 
 
 		 449 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  46.74 
 
 		 450 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  46 
 
 		 459 aa  381  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  47.12 
 
 		 456 aa  378  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  47.51 
 
 		 446 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3642  protease Do  48.06 
 
 		 456 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.393796  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  44.91 
 
 		 455 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  45.13 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  45.13 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  45.13 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  46.17 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  45.95 
 
 		 455 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  43.47 
 
 		 476 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  44.79 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4352  protease Do  45.34 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208163  decreased coverage  0.00128029 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  44.85 
 
 		 463 aa  362  6e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  45.43 
 
 		 456 aa  362  6e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  43.02 
 
 		 474 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  45.35 
 
 		 457 aa  362  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0289  protease Do  46.28 
 
 		 456 aa  362  8e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0319386  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  45.35 
 
 		 457 aa  362  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  44.97 
 
 		 462 aa  362  8e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  43.02 
 
 		 474 aa  362  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  46.07 
 
 		 456 aa  361  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  43.02 
 
 		 474 aa  362  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  42.79 
 
 		 474 aa  361  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  42.79 
 
 		 474 aa  361  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  42.79 
 
 		 474 aa  361  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  42.79 
 
 		 474 aa  361  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  43.41 
 
 		 478 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  43.41 
 
 		 478 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0220  protease Do  46.48 
 
 		 481 aa  359  5e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  43.44 
 
 		 455 aa  359  6e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  43.41 
 
 		 475 aa  359  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  43.41 
 
 		 475 aa  359  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  43.41 
 
 		 475 aa  359  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0250  heat shock protein  46.24 
 
 		 481 aa  358  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  43.71 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  43.71 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  43.71 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  43.71 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  43.71 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  43.71 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  43.71 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  43.71 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  42.57 
 
 		 474 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1284  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  45.61 
 
 		 466 aa  356  3.9999999999999996e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  44.98 
 
 		 456 aa  356  5e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  43.49 
 
 		 455 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  42.6 
 
 		 496 aa  354  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00159  hypothetical protein  42.35 
 
 		 474 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0267  protease Do  46.59 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.326354  normal  0.464292 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  43.99 
 
 		 451 aa  353  2.9999999999999997e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1285  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  45.18 
 
 		 466 aa  353  4e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03424  protease do  43.37 
 
 		 478 aa  353  4e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  43.99 
 
 		 451 aa  353  5e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  44.27 
 
 		 455 aa  352  1e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0987  serine endoprotease  42.44 
 
 		 481 aa  350  4e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2934  trypsin-like serine protease  53.64 
 
 		 374 aa  349  6e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3032  Serine protease do-like precursor  57.33 
 
 		 365 aa  349  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.722688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3452  serine endoprotease  42.44 
 
 		 481 aa  349  7e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3323  serine endoprotease  42.44 
 
 		 481 aa  349  7e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00403874  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1042  serine endoprotease  43.27 
 
 		 482 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.88791  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  42.27 
 
 		 461 aa  348  2e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3096  serine endoprotease  42.25 
 
 		 485 aa  347  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.916772  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1181  serine endoprotease  41.74 
 
 		 487 aa  345  8e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0029  serine protease  42.89 
 
 		 460 aa  343  4e-93  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2805  serine endoprotease  43.44 
 
 		 476 aa  343  5e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0024  peptidase  53.5 
 
 		 381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.02023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.88 
 
 		 476 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  43.9 
 
 		 474 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  43.9 
 
 		 474 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  50.79 
 
 		 396 aa  319  7e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  51.74 
 
 		 385 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.35 
 
 		 412 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  41.48 
 
 		 479 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  43.22 
 
 		 471 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>