More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3096 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  71.27 
 
 		 474 aa  647    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  71.27 
 
 		 474 aa  647    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3096  serine endoprotease  100 
 
 		 485 aa  966    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.916772  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  71.13 
 
 		 478 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  71.27 
 
 		 474 aa  647    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  71.06 
 
 		 474 aa  645    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3323  serine endoprotease  74.28 
 
 		 481 aa  706    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00403874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  71.27 
 
 		 474 aa  647    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  71.06 
 
 		 474 aa  645    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  71.13 
 
 		 475 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00159  hypothetical protein  70.84 
 
 		 474 aa  641    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1042  serine endoprotease  77.53 
 
 		 482 aa  702    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.88791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  77.94 
 
 		 476 aa  736    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3452  serine endoprotease  74.28 
 
 		 481 aa  706    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342049  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0987  serine endoprotease  74.28 
 
 		 481 aa  706    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  71.13 
 
 		 475 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  71.13 
 
 		 475 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  71.27 
 
 		 474 aa  647    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2805  serine endoprotease  79.91 
 
 		 476 aa  714    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1181  serine endoprotease  95.7 
 
 		 487 aa  853    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  74.22 
 
 		 496 aa  659    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  71.06 
 
 		 474 aa  645    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  71.13 
 
 		 478 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  56.4 
 
 		 463 aa  537  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  56.4 
 
 		 457 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  56.4 
 
 		 457 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  55.99 
 
 		 456 aa  527  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4352  protease Do  58.14 
 
 		 456 aa  526  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208163  decreased coverage  0.00128029 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  57.94 
 
 		 456 aa  521  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0289  protease Do  56.91 
 
 		 456 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0319386  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  55.14 
 
 		 455 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3642  protease Do  58.97 
 
 		 456 aa  507  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.393796  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  52.26 
 
 		 455 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  52.26 
 
 		 455 aa  499  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  52.26 
 
 		 455 aa  499  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  54.55 
 
 		 455 aa  501  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  52.26 
 
 		 455 aa  499  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  52.26 
 
 		 455 aa  499  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  52.26 
 
 		 455 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  52.47 
 
 		 455 aa  500  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  52.26 
 
 		 455 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  52.69 
 
 		 455 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  51.65 
 
 		 455 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  52.06 
 
 		 455 aa  498  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  51.65 
 
 		 455 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  54.53 
 
 		 456 aa  495  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  51.65 
 
 		 455 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  52.27 
 
 		 451 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  51.45 
 
 		 455 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  54.67 
 
 		 455 aa  487  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  52.88 
 
 		 462 aa  484  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  51.24 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  50.52 
 
 		 450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  50.32 
 
 		 446 aa  450  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  50.62 
 
 		 450 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  50.52 
 
 		 450 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  49.9 
 
 		 450 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  50.52 
 
 		 450 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  48.43 
 
 		 459 aa  442  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  49.69 
 
 		 450 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  49.69 
 
 		 450 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  50.84 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  49.48 
 
 		 450 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  49.69 
 
 		 451 aa  434  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  48.14 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  50 
 
 		 450 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  50.34 
 
 		 450 aa  430  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0029  serine protease  45.79 
 
 		 460 aa  426  1e-118  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  48.03 
 
 		 449 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  47.84 
 
 		 451 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  49.13 
 
 		 453 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  46.46 
 
 		 460 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  40.84 
 
 		 465 aa  350  3e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  42.76 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  41.62 
 
 		 473 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  44.15 
 
 		 457 aa  343  4e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  44.11 
 
 		 450 aa  339  7e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  41.89 
 
 		 458 aa  335  1e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  43.3 
 
 		 469 aa  335  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03424  protease do  43.01 
 
 		 478 aa  317  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0220  protease Do  42.07 
 
 		 481 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0267  protease Do  44.08 
 
 		 477 aa  312  9e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.326354  normal  0.464292 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1285  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  41.01 
 
 		 466 aa  311  1e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3731  protease DO  42.47 
 
 		 476 aa  312  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.233243  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1284  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  40.59 
 
 		 466 aa  310  4e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0250  heat shock protein  41.85 
 
 		 481 aa  309  5.9999999999999995e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  38.04 
 
 		 451 aa  307  3e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  38.04 
 
 		 451 aa  306  5.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  39.87 
 
 		 476 aa  296  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  39.65 
 
 		 476 aa  296  7e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2934  trypsin-like serine protease  42.86 
 
 		 374 aa  293  4e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  40.72 
 
 		 476 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  38.41 
 
 		 478 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  39.16 
 
 		 471 aa  286  8e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  39.1 
 
 		 479 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3032  Serine protease do-like precursor  44.9 
 
 		 365 aa  282  8.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.722688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  36.23 
 
 		 476 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  39.77 
 
 		 513 aa  278  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  36.99 
 
 		 484 aa  277  3e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  38.09 
 
 		 472 aa  277  4e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>